More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4485 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4485  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6436  extracellular solute-binding protein family 3  91.79 
 
 
268 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  44.49 
 
 
260 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  41.28 
 
 
261 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  43.88 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
258 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  40.6 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  46.98 
 
 
263 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  43.46 
 
 
261 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.02 
 
 
257 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  40.23 
 
 
253 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  38.31 
 
 
253 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.02 
 
 
257 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  41.37 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.92 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  37.04 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.29 
 
 
250 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
250 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.31 
 
 
253 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.31 
 
 
253 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
250 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.96 
 
 
268 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
250 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 
268 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
264 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.83 
 
 
260 aa  184  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  38.71 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.93 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  42.15 
 
 
263 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1787  extracellular solute-binding protein  33.45 
 
 
281 aa  178  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  39.08 
 
 
258 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6191  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 
262 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  39.08 
 
 
256 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.52 
 
 
255 aa  175  7e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.4 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  39.22 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  39.22 
 
 
259 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  40.71 
 
 
254 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.38 
 
 
259 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.78 
 
 
257 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.55 
 
 
244 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
250 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
250 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.93 
 
 
243 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  38.98 
 
 
265 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  37.33 
 
 
243 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  37.33 
 
 
243 aa  168  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.33 
 
 
243 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  37.86 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.86 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.86 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  37.86 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.86 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.48 
 
 
254 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  40.97 
 
 
257 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.86 
 
 
243 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13990  putative amino acid ABC transporter  38.53 
 
 
263 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258104  normal  0.0183711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.86 
 
 
243 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1098  extracellular solute-binding protein  37.94 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.041078  normal  0.0345837 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 
305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 
255 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
250 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.04 
 
 
243 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.45 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  37.04 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  40.53 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1240  amino acid binding protein  38.1 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0425  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
319 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.44 
 
 
243 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.72 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  41.74 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  41.74 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3571  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  39.13 
 
 
258 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.820005  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.77 
 
 
243 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.44 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6800  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8606  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.91 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.77 
 
 
244 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 
252 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1429  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.17 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0594365  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  38.43 
 
 
243 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  38.43 
 
 
243 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  38.43 
 
 
243 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  38.43 
 
 
243 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  38.43 
 
 
243 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 
248 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.6 
 
 
257 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.51 
 
 
260 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4286  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
259 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0413144  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3991  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.17 
 
 
261 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.38 
 
 
243 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.21 
 
 
261 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4841  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
259 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.608491  normal  0.182351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3207  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 
263 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  37 
 
 
243 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  37 
 
 
243 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>