More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6191 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6191  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
262 aa  507  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6710  extracellular solute-binding protein family 3  83.88 
 
 
256 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000229164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1787  extracellular solute-binding protein  40.78 
 
 
281 aa  198  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  42.06 
 
 
294 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  40.31 
 
 
260 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  40.23 
 
 
253 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 
253 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  37.84 
 
 
258 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.13 
 
 
253 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.92 
 
 
257 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.31 
 
 
257 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.13 
 
 
253 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 
261 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 
258 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4485  extracellular solute-binding protein family 3  37.66 
 
 
268 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.36 
 
 
282 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.88 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  40.34 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
268 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6436  extracellular solute-binding protein family 3  36.8 
 
 
268 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 
250 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 
250 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  39.74 
 
 
250 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  42.5 
 
 
261 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 
264 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 
250 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5167  extracellular solute-binding protein family 3  38.22 
 
 
318 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0887  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 
290 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 
252 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.05 
 
 
250 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0202  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 
306 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0788  putative ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.22 
 
 
302 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0150  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 
306 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
277 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
260 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
305 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  34.51 
 
 
258 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 
250 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0999  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 
304 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 
263 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  34.14 
 
 
254 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.4 
 
 
254 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  34.75 
 
 
257 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  36.8 
 
 
258 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0729  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 
318 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446742  normal  0.30254 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.13 
 
 
255 aa  148  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  35.02 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.48 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  36.48 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  37.66 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  37.66 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0425  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2784  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 
279 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.735869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  37.07 
 
 
256 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  34.36 
 
 
243 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 
255 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
261 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  34.36 
 
 
243 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.36 
 
 
243 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.88 
 
 
243 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
250 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  36.64 
 
 
258 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.54 
 
 
243 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  34.5 
 
 
257 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  36.29 
 
 
263 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.23 
 
 
272 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3023  extracellular solute-binding protein family 3  37.83 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.6 
 
 
243 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.88 
 
 
243 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  35.66 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  36.07 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  34.38 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  36.44 
 
 
266 aa  139  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  34.02 
 
 
257 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.6 
 
 
243 aa  138  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5069  extracellular solute-binding protein family 3  37.27 
 
 
253 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2596  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.04 
 
 
260 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2584  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.04 
 
 
260 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  33.85 
 
 
259 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2542  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.04 
 
 
260 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.579681  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
264 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2496  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.04 
 
 
260 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
264 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02195  hypothetical protein  36.12 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02235  lysine/arginine/ornithine transporter subunit  36.12 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2604  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.12 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1342  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.12 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.232393  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  32.67 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2460  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.12 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  32.67 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.67 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  32.67 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2705  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.04 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>