More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6551 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5703  extracellular solute-binding protein  98.85 
 
 
260 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6067  extracellular solute-binding protein  98.85 
 
 
260 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  93.05 
 
 
262 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  58.51 
 
 
260 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.92 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.92 
 
 
260 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.72 
 
 
262 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.23 
 
 
260 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.74 
 
 
260 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.97 
 
 
260 aa  297  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  56.07 
 
 
262 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  56.07 
 
 
260 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  56.07 
 
 
260 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.07 
 
 
260 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.07 
 
 
260 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.07 
 
 
260 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  53.28 
 
 
260 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.28 
 
 
260 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.28 
 
 
260 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55 
 
 
260 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0179055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  56.86 
 
 
267 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  56.47 
 
 
267 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  56.47 
 
 
267 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  56.47 
 
 
267 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  54.15 
 
 
257 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5004  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.73 
 
 
257 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2408  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.65 
 
 
260 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  0.0134444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1792  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  55.65 
 
 
260 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2404  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.65 
 
 
260 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.634533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2043  extracellular solute-binding protein family 3  54.77 
 
 
260 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000188394 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.75 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  55.69 
 
 
267 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  53.08 
 
 
256 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  51.57 
 
 
257 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5731  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.39 
 
 
260 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2163  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.8 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0442479  decreased coverage  0.0000000159985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2449  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.39 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2314  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.43 
 
 
258 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.626493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  54.69 
 
 
267 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0886  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.56 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.81 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  52.92 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.92 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.92 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  57.32 
 
 
264 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.53 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.53 
 
 
260 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1095  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.97 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.92 
 
 
260 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1579  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.97 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0747  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.97 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 
261 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3018  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.97 
 
 
324 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0988  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.97 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.54 
 
 
258 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1248  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.54 
 
 
324 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  56.5 
 
 
264 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  57.76 
 
 
262 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  56.3 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  52.14 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1566  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  56.83 
 
 
264 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  56.28 
 
 
265 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.64 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2917  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  56.39 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.19 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  56.64 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.19 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.19 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.19 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  56.19 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.19 
 
 
264 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  56.19 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4297  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  56.19 
 
 
264 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  56.19 
 
 
264 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  56.19 
 
 
264 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  56.19 
 
 
264 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  52.11 
 
 
255 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3300  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  53.67 
 
 
262 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2935  extracellular solute-binding protein  53.28 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0120  extracellular solute-binding protein  53.28 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1368  extracellular solute-binding protein  51.55 
 
 
259 aa  264  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0119  extracellular solute-binding protein  53.12 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876224  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26240  periplasmic histidine-binding protein HisJ  53.78 
 
 
261 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279452  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0120  extracellular solute-binding protein  56.9 
 
 
262 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614361  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  50.95 
 
 
257 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0134  extracellular solute-binding protein  55.37 
 
 
264 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2469  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  52.74 
 
 
256 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0110  extracellular solute-binding protein  56.03 
 
 
281 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0016  extracellular solute-binding protein  55.26 
 
 
263 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  47.31 
 
 
257 aa  254  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4434  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  54.39 
 
 
264 aa  254  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.14 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7091  extracellular solute-binding protein family 3  50.19 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0032  extracellular solute-binding protein family 3  54.63 
 
 
262 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  55.17 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2858  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  49.14 
 
 
260 aa  251  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  50.6 
 
 
255 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0255  extracellular solute-binding protein  50.4 
 
 
257 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3952  amino acid-binding periplasmic transport protein  54.74 
 
 
264 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>