More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5997 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5703  extracellular solute-binding protein  92.66 
 
 
260 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6067  extracellular solute-binding protein  92.66 
 
 
260 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  93.05 
 
 
260 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  58.51 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  58.2 
 
 
260 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  58.2 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.92 
 
 
260 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.77 
 
 
260 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.44 
 
 
260 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  54.44 
 
 
260 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.44 
 
 
260 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.5 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  56.54 
 
 
260 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0179055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.72 
 
 
262 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  53.54 
 
 
257 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.07 
 
 
260 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.07 
 
 
260 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.07 
 
 
260 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  56.07 
 
 
262 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  56.07 
 
 
260 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  56.07 
 
 
260 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  56.85 
 
 
267 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5004  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  56.52 
 
 
257 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2408  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.23 
 
 
260 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  0.0134444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  54.55 
 
 
257 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1792  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  55.23 
 
 
260 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  56.8 
 
 
267 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2404  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.23 
 
 
260 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.634533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  56.8 
 
 
267 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  53.44 
 
 
256 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5731  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.39 
 
 
260 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.15 
 
 
257 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  55.69 
 
 
267 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2314  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.43 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.626493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2449  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.39 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2043  extracellular solute-binding protein family 3  55.19 
 
 
260 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000188394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.81 
 
 
363 aa  287  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  54.9 
 
 
267 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  55.82 
 
 
267 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0886  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.14 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2163  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.16 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0442479  decreased coverage  0.0000000159985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  55.25 
 
 
261 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1579  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.97 
 
 
258 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1095  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.97 
 
 
258 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0747  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.97 
 
 
258 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0988  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.97 
 
 
258 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.73 
 
 
260 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  52.73 
 
 
260 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.73 
 
 
260 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3018  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.97 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  52.54 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.34 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1248  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.54 
 
 
324 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.34 
 
 
260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.73 
 
 
260 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  56.61 
 
 
264 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  51.95 
 
 
260 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  55.51 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  55.04 
 
 
260 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  56.47 
 
 
262 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1566  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.95 
 
 
264 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.84 
 
 
265 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2917  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  55.51 
 
 
264 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  50.78 
 
 
255 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0016  extracellular solute-binding protein  53.33 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.75 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  55.75 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.75 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.75 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  50.57 
 
 
257 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3300  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  53.1 
 
 
262 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.75 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.75 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  55.75 
 
 
264 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.31 
 
 
264 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  55.31 
 
 
264 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26240  periplasmic histidine-binding protein HisJ  53.36 
 
 
261 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279452  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  55.31 
 
 
264 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  55.31 
 
 
264 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1368  extracellular solute-binding protein  50.97 
 
 
259 aa  261  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0119  extracellular solute-binding protein  52.33 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876224  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4297  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  54.87 
 
 
264 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2935  extracellular solute-binding protein  52.33 
 
 
262 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0120  extracellular solute-binding protein  52.33 
 
 
262 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  54.87 
 
 
264 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2469  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  52.12 
 
 
256 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0120  extracellular solute-binding protein  56.47 
 
 
262 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614361  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4434  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  54.39 
 
 
264 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0134  extracellular solute-binding protein  55.6 
 
 
264 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0110  extracellular solute-binding protein  55.6 
 
 
281 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  55.17 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0032  extracellular solute-binding protein family 3  54.19 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  51.71 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7091  extracellular solute-binding protein family 3  51.43 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  46.56 
 
 
257 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4025  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  54.74 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2972  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  54.74 
 
 
273 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0255  extracellular solute-binding protein  49.8 
 
 
257 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3952  amino acid-binding periplasmic transport protein  54.74 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>