96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2868 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  68.29 
 
 		 182 aa  249  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  68.29 
 
 		 182 aa  249  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  49.68 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  47.02 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  46.15 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  47.92 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  45.03 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  44.23 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  44.16 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  44.81 
 
 		 185 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  43.62 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  43.51 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  40.72 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  39.01 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  39.01 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  43.05 
 
 		 209 aa  124  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  43.18 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  42.17 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  47.33 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  42.13 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  46.06 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  42.76 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  40.49 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  39.34 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  38.69 
 
 		 242 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  38.92 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  39.11 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  36.42 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  32.18 
 
 		 342 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  38.22 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  34.36 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 382 aa  95.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  37.93 
 
 		 382 aa  94.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  34.91 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  42.95 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  39.1 
 
 		 331 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  35.83 
 
 		 355 aa  84.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  33.53 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  35.81 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  35.17 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  33.76 
 
 		 346 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 348 aa  75.1  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  33.11 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  33.55 
 
 		 344 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  33.04 
 
 		 678 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 101 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  29.81 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 410 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  32.26 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  31.18 
 
 		 293 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  30.39 
 
 		 412 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 401 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0189  putative cytochrome c class I  37.63 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  28.21 
 
 		 409 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 415 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 415 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 351 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 351 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 417 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 304 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  31.91 
 
 		 304 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  32.53 
 
 		 351 aa  44.7  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  48.94 
 
 		 528 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 304 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  32.97 
 
 		 272 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  29.2 
 
 		 421 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  28.74 
 
 		 327 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  37.76 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  26.21 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4062  cytochrome c class I  32.08 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3786  cytochrome c class I  32.08 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117464  normal  0.511619 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  28.32 
 
 		 424 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 355 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  32.53 
 
 		 352 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  32.22 
 
 		 346 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  25.52 
 
 		 277 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  54.84 
 
 		 350 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  25.71 
 
 		 131 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  29.79 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  28.89 
 
 		 156 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 280 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 430 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.75 
 
 		 689 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 327 aa  41.6  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 278 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  46.15 
 
 		 524 aa  41.2  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 278 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 278 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>