50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1739 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  100 
 
 		 146 aa  296  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  51.43 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 409 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  45.28 
 
 		 410 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  40.65 
 
 		 412 aa  93.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  46.28 
 
 		 678 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  39.52 
 
 		 421 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  44.9 
 
 		 424 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  41.35 
 
 		 410 aa  90.1  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 415 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 415 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 401 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  44.09 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  40.23 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  34.15 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  37.86 
 
 		 708 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  39.29 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  33.58 
 
 		 306 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  38.04 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  38.1 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 273 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  36.96 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  38.2 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  34.12 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  40 
 
 		 275 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  29.46 
 
 		 353 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 259 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  28.95 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  33.64 
 
 		 280 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  29.35 
 
 		 187 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 304 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  41.25 
 
 		 277 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  35.48 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 295 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  30.86 
 
 		 304 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 304 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 304 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  30.59 
 
 		 342 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  41.07 
 
 		 295 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>