128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1402 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  345  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0440  cytochrome c class I  44.68 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00184102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0522  hypothetical protein  47.58 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  39.23 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6117  cytochrome c protein CopJ  42.48 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0965626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  36.7 
 
 		 196 aa  90.9  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2114  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1575  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 148 aa  88.2  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 166 aa  87.4  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  33.09 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  39.6 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  40 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  40 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3786  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117464  normal  0.511619 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4062  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1741  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0189  putative cytochrome c class I  34.19 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3236  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3596  hypothetical protein  35.92 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.705754 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  34.95 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  34.95 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  31.34 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  35.16 
 
 		 718 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  30 
 
 		 123 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 429 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  28.71 
 
 		 429 aa  48.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.64 
 
 		 425 aa  47.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  32.46 
 
 		 401 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.87 
 
 		 321 aa  47.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  29.31 
 
 		 427 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  31.03 
 
 		 398 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4251  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 286 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0839506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  30.51 
 
 		 380 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 320 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  28.47 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  30.25 
 
 		 390 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 535 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  34.15 
 
 		 485 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.09 
 
 		 318 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.83 
 
 		 382 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 418 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 535 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  28.45 
 
 		 389 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  31.96 
 
 		 438 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.71 
 
 		 723 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0664  cytochrome c oxidase  25.35 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 418 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  33.87 
 
 		 388 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.57 
 
 		 447 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 428 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  33.33 
 
 		 252 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  34.07 
 
 		 532 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  26.96 
 
 		 374 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.79 
 
 		 323 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  32.22 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.99 
 
 		 424 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 531 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.04 
 
 		 429 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 424 aa  44.7  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1747  cytochrome c, class I  29.67 
 
 		 372 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  34.44 
 
 		 373 aa  44.3  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 392 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  29.27 
 
 		 385 aa  44.3  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 		 447 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  25.88 
 
 		 101 aa  44.3  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4492  cytochrome c, class I  28.91 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  29.09 
 
 		 568 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  29.75 
 
 		 565 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 440 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  32.79 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  31.52 
 
 		 342 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  28.87 
 
 		 432 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 402 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 400 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 389 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  34.15 
 
 		 462 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 389 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  30.21 
 
 		 419 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  25.35 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  33.07 
 
 		 269 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.85 
 
 		 575 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2214  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.08 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  27.47 
 
 		 560 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 437 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  25.51 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2422  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.12 
 
 		 325 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000195931  hitchhiker  0.0000802746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  30.53 
 
 		 576 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  33.33 
 
 		 324 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  30.21 
 
 		 430 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 382 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  30.21 
 
 		 430 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29 
 
 		 298 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  30.21 
 
 		 430 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  30.21 
 
 		 430 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  31.11 
 
 		 171 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  28.18 
 
 		 568 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>