68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2987 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  79.26 
 
 		 188 aa  292  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  53.05 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  50 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  53.1 
 
 		 200 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  48.3 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  48.73 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  47.16 
 
 		 174 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  47.16 
 
 		 174 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  51.39 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  50 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  45.14 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  40.98 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  41.71 
 
 		 180 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  43.84 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  45.62 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  43.23 
 
 		 252 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  40.11 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  50 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  42.14 
 
 		 251 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  40.74 
 
 		 342 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 382 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  40.88 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  40.91 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  39.49 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  43.87 
 
 		 243 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  37.97 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  42.31 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  39.26 
 
 		 206 aa  111  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  36.67 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  36.67 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  36.36 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  32.4 
 
 		 348 aa  94.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 344 aa  94.4  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  36.13 
 
 		 382 aa  94.4  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  35.26 
 
 		 344 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 360 aa  85.5  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  32.34 
 
 		 355 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  33.11 
 
 		 346 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  31.54 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  32.95 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  29.05 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  30.1 
 
 		 678 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  28.07 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 410 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  29.21 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  29.03 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  29.03 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  28.23 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  29.03 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  24.26 
 
 		 409 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  31.43 
 
 		 291 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  28.42 
 
 		 421 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 401 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  30.69 
 
 		 293 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  25.23 
 
 		 424 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 415 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 415 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 278 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.13 
 
 		 296 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  52.78 
 
 		 290 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  27.17 
 
 		 412 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>