35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2939 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1051    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  61.78 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  52.5 
 
 		 506 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  48.59 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  41.42 
 
 		 477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  39.12 
 
 		 483 aa  322  7e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  37.13 
 
 		 622 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  37.7 
 
 		 628 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  39.75 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  36.48 
 
 		 503 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  25.87 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  26.84 
 
 		 631 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  26.09 
 
 		 624 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  26.47 
 
 		 631 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  25.14 
 
 		 580 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  35.32 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  32.07 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  26.68 
 
 		 605 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  25.2 
 
 		 568 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  48.08 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  47.12 
 
 		 624 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  45.19 
 
 		 602 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  25.15 
 
 		 585 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  45.19 
 
 		 634 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  46.15 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  46.15 
 
 		 634 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  42.59 
 
 		 575 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  44.23 
 
 		 595 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  37.76 
 
 		 624 aa  76.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  40.48 
 
 		 935 aa  73.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  41.8 
 
 		 715 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  39.42 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  28.41 
 
 		 678 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  30.99 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1647  hypothetical protein  26.32 
 
 		 522 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>