36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3211 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  96.79 
 
 		 624 aa  1221    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1273    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  42.28 
 
 		 634 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  42.28 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  34.75 
 
 		 602 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  31.4 
 
 		 580 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  31.03 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  28.46 
 
 		 631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  27.69 
 
 		 715 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  28.48 
 
 		 624 aa  177  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  28.22 
 
 		 631 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  27.52 
 
 		 575 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  27.27 
 
 		 595 aa  153  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  25.08 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  29.7 
 
 		 605 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  27.15 
 
 		 602 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  26.94 
 
 		 935 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  29.17 
 
 		 568 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  27.65 
 
 		 624 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  30.56 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  51.49 
 
 		 628 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  49 
 
 		 622 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  48.51 
 
 		 491 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  50 
 
 		 483 aa  97.4  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  49.53 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  48.08 
 
 		 505 aa  96.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  29.12 
 
 		 386 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  45.19 
 
 		 506 aa  93.2  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  45 
 
 		 477 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  37.93 
 
 		 492 aa  87.8  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  41.88 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  42.11 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  41.23 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  25.7 
 
 		 183 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  28.66 
 
 		 676 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  67.57 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>