36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5961 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1203    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  37.83 
 
 		 551 aa  327  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  37.86 
 
 		 580 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  36.07 
 
 		 568 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  35.84 
 
 		 634 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  34.29 
 
 		 575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  35.66 
 
 		 634 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  35.75 
 
 		 624 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  33.01 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  32.47 
 
 		 624 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  34.75 
 
 		 624 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  33.99 
 
 		 605 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  33.78 
 
 		 631 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  33.61 
 
 		 631 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  33.82 
 
 		 602 aa  244  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  32.59 
 
 		 580 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  32.67 
 
 		 624 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  30.62 
 
 		 935 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  36.43 
 
 		 715 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  24.26 
 
 		 585 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  37.58 
 
 		 183 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  28.21 
 
 		 386 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  43.44 
 
 		 515 aa  92  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  45.19 
 
 		 505 aa  91.3  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  45.19 
 
 		 628 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  36.05 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  39.84 
 
 		 622 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  43.27 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  41.26 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  42.48 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  38.97 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  38.83 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  35.14 
 
 		 532 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  42.06 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  62.5 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  44.23 
 
 		 676 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>