39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05639 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  100 
 
 		 628 aa  1302    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  62.02 
 
 		 622 aa  796    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  44.27 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  40.04 
 
 		 477 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  42.04 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  36.4 
 
 		 483 aa  332  9e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  39.71 
 
 		 492 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  39.21 
 
 		 515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  39.36 
 
 		 503 aa  303  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  37.7 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  26.49 
 
 		 580 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  25.86 
 
 		 605 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  25.38 
 
 		 551 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  26.39 
 
 		 631 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  26.59 
 
 		 631 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  30.04 
 
 		 532 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  51.49 
 
 		 624 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  27.13 
 
 		 479 aa  100  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  50.5 
 
 		 624 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  29.24 
 
 		 585 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  45.19 
 
 		 602 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  49.02 
 
 		 634 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  49.02 
 
 		 634 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4602  hypothetical protein  37.61 
 
 		 165 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.902836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  47.42 
 
 		 624 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  40.94 
 
 		 715 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  43.69 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  40 
 
 		 935 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  43.27 
 
 		 568 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  42.71 
 
 		 602 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  38.1 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  37.39 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  36 
 
 		 575 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  31.34 
 
 		 386 aa  63.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4646  hypothetical protein  31.01 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000326629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  31.2 
 
 		 678 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 390 aa  47.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  31.36 
 
 		 333 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>