39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4647 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  991    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  53.39 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  45.89 
 
 		 503 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  43.62 
 
 		 491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  44.26 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  41.59 
 
 		 622 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  41.04 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  38.88 
 
 		 628 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  40.7 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  37.76 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  33.62 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  45 
 
 		 624 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  44 
 
 		 624 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  25.43 
 
 		 551 aa  87  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  25.55 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  41.41 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  46.08 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  27.76 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  47.52 
 
 		 624 aa  80.9  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  23.38 
 
 		 631 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  26.92 
 
 		 631 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  40.19 
 
 		 580 aa  73.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  42.16 
 
 		 568 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  43.14 
 
 		 595 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  43.56 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  38.83 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  41.35 
 
 		 575 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  25.5 
 
 		 678 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  35.71 
 
 		 634 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  40.5 
 
 		 715 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  34.4 
 
 		 634 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  23.56 
 
 		 676 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1647  hypothetical protein  26.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  35.77 
 
 		 935 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4602  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.902836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2098  hypothetical protein  33.9 
 
 		 567 aa  47  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  30.19 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>