43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4645 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  1016    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  60.52 
 
 
506 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  48.99 
 
 
505 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  47.58 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  44.44 
 
 
477 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  41.33 
 
 
483 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  44.49 
 
 
628 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  43.27 
 
 
622 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  40.79 
 
 
492 aa  326  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  36.78 
 
 
503 aa  302  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  29.28 
 
 
551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  26.67 
 
 
580 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  31.68 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  33.33 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  24.21 
 
 
605 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  25.79 
 
 
631 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  25.2 
 
 
631 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  48.51 
 
 
624 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  47.52 
 
 
624 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  23.91 
 
 
624 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  44 
 
 
585 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  36.05 
 
 
602 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  46.08 
 
 
634 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  47.52 
 
 
634 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  44.12 
 
 
580 aa  81.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  44.55 
 
 
624 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  42.86 
 
 
568 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  39.22 
 
 
595 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  31.69 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  39.81 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  24.46 
 
 
678 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  36.89 
 
 
602 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  36 
 
 
935 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  37.01 
 
 
715 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  21.93 
 
 
676 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1647  hypothetical protein  25.23 
 
 
522 aa  56.6  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2357  hypothetical protein  25.11 
 
 
645 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4602  hypothetical protein  25 
 
 
165 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.902836  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  40.43 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.4 
 
 
652 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  25.99 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  27.86 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0153  hypothetical protein  26.17 
 
 
707 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00172634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>