37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1167    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  63.24 
 
 		 575 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  54 
 
 		 595 aa  598  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  53.39 
 
 		 602 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  49.43 
 
 		 624 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  53.15 
 
 		 580 aa  535  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  36.07 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  58.38 
 
 		 183 aa  216  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  30.32 
 
 		 551 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  31.6 
 
 		 580 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  29.82 
 
 		 631 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  30.15 
 
 		 631 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  30.9 
 
 		 605 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  29.32 
 
 		 624 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  29.31 
 
 		 634 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  29.37 
 
 		 634 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  28.29 
 
 		 935 aa  163  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  26.19 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  29.2 
 
 		 624 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  27.55 
 
 		 624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  29.12 
 
 		 715 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  25.2 
 
 		 505 aa  97.4  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  29.12 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  24.52 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  38.97 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  45.1 
 
 		 622 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  42.86 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  41.23 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  43.64 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  42.16 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  43.27 
 
 		 628 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  42.71 
 
 		 483 aa  67  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  37.86 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0007  hypothetical protein  76.32 
 
 		 90 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  21.16 
 
 		 676 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  29.2 
 
 		 386 aa  53.5  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  23.53 
 
 		 678 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>