21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1293 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  384  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  74.23 
 
 		 575 aa  263  8.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  60.12 
 
 		 568 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  49.42 
 
 		 595 aa  175  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  47.4 
 
 		 624 aa  161  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  50 
 
 		 602 aa  157  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  52.15 
 
 		 580 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  37.58 
 
 		 602 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  31.21 
 
 		 580 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  31.87 
 
 		 551 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  29.15 
 
 		 935 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  30.41 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  34.32 
 
 		 605 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  26.26 
 
 		 624 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  29.14 
 
 		 585 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  32.54 
 
 		 631 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  28.35 
 
 		 634 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  26.83 
 
 		 624 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  31.95 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  28.35 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  29.76 
 
 		 624 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>