35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1586 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  100 
 
 		 715 aa  1482    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  36.83 
 
 		 551 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  36.43 
 
 		 602 aa  206  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  28.2 
 
 		 624 aa  187  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  24.84 
 
 		 935 aa  181  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  33.01 
 
 		 624 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  32.61 
 
 		 624 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  31.88 
 
 		 605 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  32.58 
 
 		 580 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  27.06 
 
 		 595 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  32.55 
 
 		 634 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  27.26 
 
 		 602 aa  162  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  31.21 
 
 		 634 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  26.3 
 
 		 624 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  34.12 
 
 		 575 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  29.12 
 
 		 568 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  27.25 
 
 		 580 aa  107  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  27.91 
 
 		 585 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  31.58 
 
 		 631 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  31.1 
 
 		 631 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  30.41 
 
 		 183 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  40.94 
 
 		 628 aa  77  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  39.37 
 
 		 622 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  41.8 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  39.34 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  25.41 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  39.02 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  36.75 
 
 		 386 aa  66.6  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  35.42 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  37.01 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  40.5 
 
 		 477 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  37.19 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  38.39 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  23.81 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  37.76 
 
 		 678 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>