37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39440 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  67.85 
 
 		 624 aa  888    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1303    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  96.35 
 
 		 631 aa  1265    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  65.74 
 
 		 605 aa  793    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  35.21 
 
 		 551 aa  300  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  36.19 
 
 		 580 aa  299  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  30.99 
 
 		 935 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  33.78 
 
 		 602 aa  250  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  29.14 
 
 		 634 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  30.19 
 
 		 634 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  30.1 
 
 		 568 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  29.75 
 
 		 575 aa  190  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  27.48 
 
 		 595 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  28.33 
 
 		 624 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  28.57 
 
 		 624 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  30.35 
 
 		 580 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  26.22 
 
 		 585 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  28.12 
 
 		 602 aa  153  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  29.14 
 
 		 624 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  28.24 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  25.14 
 
 		 622 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  26.59 
 
 		 628 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  26.84 
 
 		 505 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  26.12 
 
 		 506 aa  98.6  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  24.42 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  31.58 
 
 		 715 aa  94  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  26.24 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  24.61 
 
 		 483 aa  88.2  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  25 
 
 		 515 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  28.16 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  23.91 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  26.92 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  31.95 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  36.62 
 
 		 503 aa  67  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  32.35 
 
 		 676 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  30.14 
 
 		 678 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  36.84 
 
 		 458 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>