36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3351 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  96.35 
 
 		 631 aa  1222    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  68.45 
 
 		 624 aa  878    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1299    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  65.22 
 
 		 605 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  35.79 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  34.97 
 
 		 551 aa  301  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  30.7 
 
 		 935 aa  250  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  33.61 
 
 		 602 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  28.97 
 
 		 634 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  30.44 
 
 		 568 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  29.59 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  27.62 
 
 		 595 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  28.86 
 
 		 624 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  27.91 
 
 		 624 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  31.01 
 
 		 580 aa  163  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  26.22 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  28.23 
 
 		 602 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  30.31 
 
 		 634 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  27.74 
 
 		 386 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  29.62 
 
 		 624 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  25.32 
 
 		 622 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  26.39 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  26.47 
 
 		 505 aa  107  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  25.6 
 
 		 506 aa  104  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  25.6 
 
 		 491 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  31.1 
 
 		 715 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  24.65 
 
 		 483 aa  87.4  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  28.65 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  25 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  27.8 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  24.81 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  32.54 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  23.95 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  26.86 
 
 		 532 aa  68.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  31.36 
 
 		 676 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  28.7 
 
 		 678 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>