33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1446 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  100 
 
 		 678 aa  1387    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  38.07 
 
 		 676 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  24.8 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  23.78 
 
 		 479 aa  96.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  31.43 
 
 		 515 aa  72  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  24.18 
 
 		 506 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  30.9 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  25.5 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  28.28 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  28.41 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  25.99 
 
 		 580 aa  64.7  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  67.57 
 
 		 624 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  67.57 
 
 		 624 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  31.78 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  24.46 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  62.5 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  30.14 
 
 		 631 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  37.76 
 
 		 715 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  28.7 
 
 		 631 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  26.24 
 
 		 580 aa  55.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  42.31 
 
 		 605 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  60.53 
 
 		 624 aa  54.3  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  26.44 
 
 		 622 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  26.67 
 
 		 483 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  71.43 
 
 		 935 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  60 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  23.53 
 
 		 568 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  31.2 
 
 		 628 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  24.53 
 
 		 575 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  61.76 
 
 		 602 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  68.97 
 
 		 386 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  57.14 
 
 		 595 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  35.21 
 
 		 585 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>