36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1670 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  60.53 
 
 		 624 aa  753    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  63.56 
 
 		 631 aa  800    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1246    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  65.51 
 
 		 631 aa  785    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  35.63 
 
 		 580 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  35.46 
 
 		 551 aa  291  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  33.53 
 
 		 935 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  33.83 
 
 		 602 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  29.38 
 
 		 634 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  28.92 
 
 		 634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  30.9 
 
 		 568 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  29.69 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  30.08 
 
 		 624 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  31.88 
 
 		 715 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  26.57 
 
 		 585 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  26.86 
 
 		 595 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  28.81 
 
 		 580 aa  143  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  28.21 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  28.68 
 
 		 624 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  29.7 
 
 		 624 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  25.58 
 
 		 622 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  25.86 
 
 		 628 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  26.58 
 
 		 386 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  24.51 
 
 		 506 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  23.81 
 
 		 491 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  26.68 
 
 		 505 aa  98.2  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  24.56 
 
 		 515 aa  97.8  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  25.34 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  25.55 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  27.44 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  27.17 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  27.19 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  34.32 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  28 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  42.31 
 
 		 678 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  26.69 
 
 		 676 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>