40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3772 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1107    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  32.02 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  24.8 
 
 		 678 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  32.27 
 
 		 622 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  31.21 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  31.27 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  24.86 
 
 		 676 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  34.45 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  33.91 
 
 		 515 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  28.95 
 
 		 551 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  30.04 
 
 		 628 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  32.07 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  30.64 
 
 		 503 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  29.12 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  26.07 
 
 		 580 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  41.88 
 
 		 624 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  27.68 
 
 		 585 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  41.03 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  27.44 
 
 		 605 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  30.91 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  43.4 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  35.85 
 
 		 935 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  25.87 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  26.92 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  26.15 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  25.41 
 
 		 715 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  39.25 
 
 		 624 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  35.14 
 
 		 602 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  38.18 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  36.36 
 
 		 602 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  37.96 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  29.41 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  37.96 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1647  hypothetical protein  25.2 
 
 		 522 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.8 
 
 		 308 aa  45.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 312 aa  43.5  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6221  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.29 
 
 		 810 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>