199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2059 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  100 
 
 		 382 aa  785    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  42.22 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  41.59 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  41.44 
 
 		 242 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  42.72 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  42.51 
 
 		 260 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  43.92 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  41.63 
 
 		 211 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  35.86 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  39.68 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  41.99 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  44.38 
 
 		 195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  44.65 
 
 		 181 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 194 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 194 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  44.16 
 
 		 179 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  43.87 
 
 		 180 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  43.62 
 
 		 200 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  45.86 
 
 		 185 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  46.62 
 
 		 174 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  41.1 
 
 		 171 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  27.83 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  35.43 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  38.31 
 
 		 180 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  29.06 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  35.75 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  37.5 
 
 		 209 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  39.26 
 
 		 180 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  34.72 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  40.38 
 
 		 200 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  34.05 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  36.27 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  37.42 
 
 		 186 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  31.22 
 
 		 239 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  39.74 
 
 		 206 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 187 aa  93.2  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  34.84 
 
 		 188 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  36.13 
 
 		 182 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  36.13 
 
 		 182 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  36.13 
 
 		 188 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  29.92 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  48.72 
 
 		 185 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  44.71 
 
 		 134 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  38.56 
 
 		 202 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  43.9 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  44.44 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  41.12 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  46.75 
 
 		 140 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  42.86 
 
 		 129 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  38.75 
 
 		 131 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  43.75 
 
 		 111 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  38.36 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  39.29 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  44.05 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  43.42 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  43.42 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  44.3 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  44.3 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  36.25 
 
 		 230 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  39.56 
 
 		 141 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  40.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  42.5 
 
 		 111 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  41.25 
 
 		 112 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  29.36 
 
 		 112 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  37.08 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  42.5 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0152  cytochrome c-555  41.25 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110389  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  35.96 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  50.91 
 
 		 297 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 101 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  28.23 
 
 		 179 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  41.25 
 
 		 140 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  28.23 
 
 		 180 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>