178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2630 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  100 
 
 		 404 aa  824    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  55.56 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  54.42 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  50.85 
 
 		 360 aa  352  4e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  47.7 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  52.27 
 
 		 344 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  49.01 
 
 		 344 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  50.14 
 
 		 346 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  50.14 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  41.71 
 
 		 342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  38.74 
 
 		 211 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 194 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  40.11 
 
 		 225 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  44.3 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  38.66 
 
 		 252 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  37.31 
 
 		 251 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  37.97 
 
 		 242 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 243 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 222 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  37.24 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  37.56 
 
 		 260 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  40.96 
 
 		 181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  43.67 
 
 		 185 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  41.57 
 
 		 174 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  41.57 
 
 		 174 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  43.04 
 
 		 180 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  39.88 
 
 		 179 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 200 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  33.82 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  44 
 
 		 174 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  41.03 
 
 		 180 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  39.57 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  38.86 
 
 		 195 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  31.96 
 
 		 206 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  37.36 
 
 		 171 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  34.46 
 
 		 209 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  33.54 
 
 		 180 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  40.74 
 
 		 186 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 200 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  50.67 
 
 		 101 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  48.94 
 
 		 106 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  43.56 
 
 		 111 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  47.95 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  47.5 
 
 		 119 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  47.5 
 
 		 119 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  43.84 
 
 		 102 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  46.25 
 
 		 117 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  46.25 
 
 		 117 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  46.25 
 
 		 117 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  50 
 
 		 101 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  48.68 
 
 		 108 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  45.56 
 
 		 102 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  48.68 
 
 		 123 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  50 
 
 		 120 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  50 
 
 		 110 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  51.47 
 
 		 101 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  42.47 
 
 		 104 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  45.12 
 
 		 106 aa  77  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  51.35 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  50 
 
 		 109 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3583  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  52.7 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  47.95 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  50 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  37.29 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  38.05 
 
 		 1138 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2906  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 155 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 111 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 108 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  32.48 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 108 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  50 
 
 		 101 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  50 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 115 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  48.53 
 
 		 102 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1565  cytochrome c class I  47.3 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 800 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  45.12 
 
 		 106 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  42.47 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  42.47 
 
 		 104 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  46.05 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  51.35 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  46.05 
 
 		 107 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  46.05 
 
 		 108 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  46.05 
 
 		 108 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>