172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0802 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  100 
 
 		 360 aa  751    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  55.56 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  55.76 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  55.59 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  55.21 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  54.8 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  55.11 
 
 		 344 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  49.43 
 
 		 404 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  48.16 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  77.08 
 
 		 96 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  42.55 
 
 		 211 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  38.07 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 243 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  39.04 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  39.27 
 
 		 260 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  40.88 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 259 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  39.04 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 194 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 194 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  41.38 
 
 		 185 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  36.36 
 
 		 225 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  37.63 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  42.31 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  42.58 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  40.72 
 
 		 195 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  41.94 
 
 		 180 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  40.49 
 
 		 179 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  40.13 
 
 		 174 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  40.13 
 
 		 174 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  29.06 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  40.27 
 
 		 174 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  41.86 
 
 		 202 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  40.13 
 
 		 180 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  61.64 
 
 		 101 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  60.53 
 
 		 102 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  60.53 
 
 		 101 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  60.53 
 
 		 101 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  57.14 
 
 		 105 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  56.41 
 
 		 108 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  60.53 
 
 		 102 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  55.13 
 
 		 108 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  54.67 
 
 		 101 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 106 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  59.21 
 
 		 104 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  37.01 
 
 		 171 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  51.85 
 
 		 104 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  53.16 
 
 		 104 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  53.85 
 
 		 123 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  34.76 
 
 		 186 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  46.32 
 
 		 106 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  51.16 
 
 		 119 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  51.16 
 
 		 119 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  53.85 
 
 		 110 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  51.95 
 
 		 108 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  54.55 
 
 		 104 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  49.43 
 
 		 117 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  49.43 
 
 		 117 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  49.43 
 
 		 117 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  50.54 
 
 		 102 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  56 
 
 		 141 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  28.8 
 
 		 239 aa  89.7  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  45.1 
 
 		 106 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  47.87 
 
 		 120 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  50.67 
 
 		 101 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  52.63 
 
 		 208 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  57.14 
 
 		 101 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  51.32 
 
 		 115 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 188 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  51.32 
 
 		 106 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  29.15 
 
 		 209 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  48.04 
 
 		 118 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  54.43 
 
 		 116 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  50 
 
 		 228 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  48.42 
 
 		 101 aa  86.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  48.05 
 
 		 218 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 111 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  34.93 
 
 		 200 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  50 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  52.11 
 
 		 115 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  50 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  50 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  52.11 
 
 		 115 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  50 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  50 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  50.65 
 
 		 115 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  38.79 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  28.57 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  50 
 
 		 111 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  50 
 
 		 110 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 108 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  46.75 
 
 		 102 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  49.33 
 
 		 93 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  44.9 
 
 		 105 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  31.01 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  51.81 
 
 		 104 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  48.68 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  48.05 
 
 		 1151 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  48.75 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>