180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4892 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  67.69 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  39.36 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0811  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit B  65.96 
 
 		 123 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2691  cytochrome c family protein  44.63 
 
 		 155 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600799  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1486  cytochrome c, class I  41.75 
 
 		 103 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  58.82 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  62.5 
 
 		 101 aa  98.6  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  51.28 
 
 		 344 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  54.46 
 
 		 101 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  57.89 
 
 		 115 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  51.81 
 
 		 104 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  52.56 
 
 		 108 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  57.65 
 
 		 101 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  53.09 
 
 		 102 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  57.65 
 
 		 101 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 106 aa  91.7  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  49.37 
 
 		 123 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  41.82 
 
 		 348 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  50 
 
 		 115 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  52.78 
 
 		 118 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  51.19 
 
 		 101 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  50 
 
 		 115 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  48.24 
 
 		 106 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 105 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  52.56 
 
 		 108 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  55.26 
 
 		 101 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  53.52 
 
 		 141 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  54.88 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  50.6 
 
 		 104 aa  88.6  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  55.13 
 
 		 131 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  55.13 
 
 		 131 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  48.15 
 
 		 105 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  48.1 
 
 		 101 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 106 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  45.78 
 
 		 119 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  51.39 
 
 		 116 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  50.63 
 
 		 102 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  44.71 
 
 		 120 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  45.78 
 
 		 119 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 111 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  50.59 
 
 		 104 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  49.33 
 
 		 360 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  48.61 
 
 		 249 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 117 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 117 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 117 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  45 
 
 		 110 aa  85.9  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  47.83 
 
 		 118 aa  85.5  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  49.33 
 
 		 96 aa  85.1  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  57.33 
 
 		 101 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  48.61 
 
 		 115 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  46.91 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  51.95 
 
 		 104 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  40.38 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  44.3 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 800 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  49.37 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  49.37 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  47.44 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  53.52 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  45.45 
 
 		 909 aa  81.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 102 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1454  cytochrome c oxidoreductase subunit B  42.05 
 
 		 106 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  43.04 
 
 		 110 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  43.21 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  45.56 
 
 		 117 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0256  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  43.42 
 
 		 111 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290356  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2671  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  43.42 
 
 		 111 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  47.89 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  49.41 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  43.04 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  44.3 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  43.04 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  43.04 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  43.04 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  43.04 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  43.04 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  38.6 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3023  cytochrome c oxidoreductase subunit B  40.82 
 
 		 110 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  46.75 
 
 		 93 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 108 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  43.04 
 
 		 107 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  50 
 
 		 404 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0987  cytochrome c class I  47.14 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8663  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  40.24 
 
 		 110 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  35.09 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3635  putative cytochrome c, class I  47.14 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0318  cytochrome c class I  50.72 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00066919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>