25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3023 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3023  cytochrome c oxidoreductase subunit B  100 
 
 		 110 aa  228  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3395  cytochrome c oxidoreductase subunit B  72.73 
 
 		 110 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1454  cytochrome c oxidoreductase subunit B  60.92 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8663  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  46.53 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0256  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  54.88 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290356  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2671  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  54.88 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4216  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  48.89 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  40.82 
 
 		 218 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8370  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  47.67 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5266  hypothetical protein  47.37 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2703  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  46.51 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5387  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  44.83 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6452  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  50 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0811  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit B  40.26 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  38.78 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2691  cytochrome c family protein  40.7 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600799  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1979  hypothetical protein  41.98 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2782  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  47.3 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  42.67 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3717  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  48.15 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4628  hypothetical protein  35.06 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  39.73 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2837  hypothetical protein  36.84 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1486  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>