30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0083 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8663  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  46.48 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1454  cytochrome c oxidoreductase subunit B  45.07 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2703  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  44.16 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8370  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  44.16 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2671  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  49.21 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0256  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  49.21 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290356  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4216  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  47.46 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2782  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  42.42 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0811  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit B  37.93 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3395  cytochrome c oxidoreductase subunit B  39.71 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  39.68 
 
 		 208 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3023  cytochrome c oxidoreductase subunit B  39.73 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  34.85 
 
 		 232 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5387  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  44.07 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  36.51 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2837  hypothetical protein  35.44 
 
 		 218 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3097  cytochrome c-552 like protein  33.85 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1979  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  41.94 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  34.92 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6452  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  39.34 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2691  cytochrome c family protein  37.04 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600799  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  36.07 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2550  hypothetical protein  26.67 
 
 		 129 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.47034  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1979  hypothetical protein  34.43 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  32.63 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5266  hypothetical protein  29.69 
 
 		 112 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>