26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3395 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3395  cytochrome c oxidoreductase subunit B  100 
 
 		 110 aa  227  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3023  cytochrome c oxidoreductase subunit B  72.73 
 
 		 110 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1454  cytochrome c oxidoreductase subunit B  53.66 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0256  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  54.88 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290356  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2671  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  54.88 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8663  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  39.81 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4216  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  42.61 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5266  hypothetical protein  48.68 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6452  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  50 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  39.56 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8370  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  43.02 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2703  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  43.9 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0811  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit B  40.26 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  35.24 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5387  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  39.53 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2691  cytochrome c family protein  34.86 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600799  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  36.54 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1979  hypothetical protein  39.74 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2782  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  41.84 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4628  hypothetical protein  36.99 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  42.42 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  39.71 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2837  hypothetical protein  34.67 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3717  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  40 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1486  cytochrome c, class I  35.94 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>