26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2671 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2671  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  100 
 
 		 111 aa  233  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0256  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  100 
 
 		 111 aa  233  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290356  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1454  cytochrome c oxidoreductase subunit B  63.64 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4216  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  58.82 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5387  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  61.9 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8663  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  46.79 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6452  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  65.71 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2703  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  57.14 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8370  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  55.95 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3395  cytochrome c oxidoreductase subunit B  50 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3023  cytochrome c oxidoreductase subunit B  54.65 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  40.62 
 
 		 218 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  40.82 
 
 		 208 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2691  cytochrome c family protein  45.16 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600799  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1486  cytochrome c, class I  34.41 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3717  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  65.38 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0811  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit B  42.67 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5266  hypothetical protein  43.33 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  40.51 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  41.05 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2782  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  50.79 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  49.21 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4628  hypothetical protein  36.11 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1979  hypothetical protein  32.95 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2837  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0203  hypothetical protein  29.7 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>