27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5266 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5266  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  50.94 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3395  cytochrome c oxidoreductase subunit B  41.12 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3023  cytochrome c oxidoreductase subunit B  42.72 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4628  hypothetical protein  37.04 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1454  cytochrome c oxidoreductase subunit B  43.24 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0256  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  44.74 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290356  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2671  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  44.74 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1979  hypothetical protein  44.94 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5387  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  47.46 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8663  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  33.33 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2703  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  45.61 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  46.67 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8370  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  43.33 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  44.83 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2691  cytochrome c family protein  36.11 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600799  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4216  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  45.61 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6452  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  46 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2782  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  37.7 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0811  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit B  39.66 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  31.07 
 
 		 229 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1486  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  29.85 
 
 		 121 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0917  hypothetical protein  29.85 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  36.51 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2837  hypothetical protein  32.26 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  29.69 
 
 		 92 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>