26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2703 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2703  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8370  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  95.33 
 
 		 107 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4216  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  64.42 
 
 		 105 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5387  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  64.29 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8663  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  59.55 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6452  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  70.27 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0256  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  57.14 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290356  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2671  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  57.14 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1454  cytochrome c oxidoreductase subunit B  50 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3717  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  67.86 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3023  cytochrome c oxidoreductase subunit B  46.81 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3395  cytochrome c oxidoreductase subunit B  41.07 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  45.9 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  47.54 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2691  cytochrome c family protein  41.05 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600799  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  44.16 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1486  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0811  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit B  35.44 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2782  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  49.23 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5266  hypothetical protein  45.61 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  34.55 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1979  hypothetical protein  34.52 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4628  hypothetical protein  38.6 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0203  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2837  hypothetical protein  37.88 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>