21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2873 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  273  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  45.45 
 
 
113 aa  90.1  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  43.4 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  40.98 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  38.52 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  48.19 
 
 
131 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  44.21 
 
 
183 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  43.82 
 
 
111 aa  84.3  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  39.09 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  44.21 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  43.62 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  43.62 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  42.11 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  37.29 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3097  cytochrome c-552 like protein  31.96 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0811  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit B  30.14 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  36.07 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0917  hypothetical protein  37.7 
 
 
121 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606921  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  36.07 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  39.06 
 
 
208 aa  40  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>