146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0200 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  100 
 
 
123 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  83.19 
 
 
117 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  83.19 
 
 
117 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  83.19 
 
 
117 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  77.78 
 
 
120 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  92.22 
 
 
119 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  91.11 
 
 
119 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  82.98 
 
 
111 aa  160  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  84.88 
 
 
228 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  84.88 
 
 
121 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  84.88 
 
 
121 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  84.88 
 
 
121 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  84.88 
 
 
121 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  84.88 
 
 
121 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  84.88 
 
 
111 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  77.38 
 
 
115 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  61.86 
 
 
116 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  73.03 
 
 
118 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  58.49 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  68.29 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  66.27 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  66.27 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  72.73 
 
 
141 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  46.24 
 
 
117 aa  103  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  52.87 
 
 
106 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  55.26 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  46.94 
 
 
106 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  45.05 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  51.28 
 
 
115 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  50 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  52.04 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  49.5 
 
 
360 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  45.26 
 
 
348 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  52.05 
 
 
208 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  48.96 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  50 
 
 
344 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  55.7 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  48.68 
 
 
102 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  52 
 
 
102 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  49.35 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  45.92 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  48.39 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  53.25 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  55.71 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  51.32 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  51.32 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  49.35 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  55.26 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  45.88 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  49.41 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  49.37 
 
 
218 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  50.54 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  48.68 
 
 
197 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  50.65 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  48.68 
 
 
110 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  47.37 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  51.95 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  39.22 
 
 
249 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  50.65 
 
 
101 aa  87.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  50.65 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  47.13 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
800 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  35.24 
 
 
108 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  35.24 
 
 
108 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  35.24 
 
 
108 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  37.78 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  41.9 
 
 
941 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  51.35 
 
 
355 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  47.87 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  40.74 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  39.13 
 
 
1151 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3038  cytochrome c, class I  42.11 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277662  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  39.13 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  39.24 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  40.22 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  41.03 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  41.57 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  40.35 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  41.94 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  40 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  41.89 
 
 
908 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  47.44 
 
 
404 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  40.48 
 
 
1143 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  44 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1962  cytochrome c family protein  43.04 
 
 
91 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  41.25 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  38.75 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  38.75 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  40.62 
 
 
984 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  38.75 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  38.75 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  38.75 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  38.75 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  38.75 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  36.54 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  50.72 
 
 
918 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1630  cytochrome c class I  43.04 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000303587  hitchhiker  0.0000000150302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2906  cytochrome c class I  38.64 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3583  cytochrome c, class I  38.64 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>