146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2528 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  100 
 
 		 101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  70.41 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  70.41 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  68.37 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  62.38 
 
 		 101 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  59.05 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  62.63 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  76.71 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  58.16 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  64.89 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  56.25 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  57.61 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  62.96 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  62.5 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  60.23 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  57.43 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  54.44 
 
 		 93 aa  105  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  59.04 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  51.61 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  53.75 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  56.63 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  54.44 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  50.51 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  50.51 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  50.51 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  55.84 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  57.33 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  58.67 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  54.67 
 
 		 360 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  60 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  48.48 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  53.25 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  55 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  50 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  53.25 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  53.25 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  53.25 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  51.95 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  53.25 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  53.25 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  57.69 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  57.53 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  48.86 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  50 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  50 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  50 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  50 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  50 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  50 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  55.26 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  53.25 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  51.95 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  55.26 
 
 		 218 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 228 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  50.52 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  50 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  50.52 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3635  putative cytochrome c, class I  54.93 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  58.33 
 
 		 208 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  46.81 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  55.26 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  55.26 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  49.33 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  53.25 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 800 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0987  cytochrome c class I  54.93 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1033  cytochrome c, class I  44.66 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.30031  normal  0.50008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  51.32 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0318  cytochrome c class I  49.38 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00066919  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  50.67 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  42.31 
 
 		 344 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 1151 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  44.16 
 
 		 348 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  46.75 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  45.56 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  44.44 
 
 		 1138 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  45.36 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  44 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  50 
 
 		 984 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  50 
 
 		 404 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  42.67 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  43.04 
 
 		 909 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  45.33 
 
 		 941 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  45.36 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  37.23 
 
 		 908 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3583  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  41.76 
 
 		 1143 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  44 
 
 		 918 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2906  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>