More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3440 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  44.01 
 
 		 984 aa  723    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  42.34 
 
 		 1444 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1143 aa  2362    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  48.94 
 
 		 941 aa  813    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  61.05 
 
 		 1135 aa  1400    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  41.6 
 
 		 909 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  45.99 
 
 		 1182 aa  1006    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  43.09 
 
 		 918 aa  706    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  49.77 
 
 		 1142 aa  1060    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  46.48 
 
 		 1138 aa  980    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  46.29 
 
 		 1505 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  46.5 
 
 		 918 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  40.5 
 
 		 1200 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  50.76 
 
 		 1151 aa  1104    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  41.93 
 
 		 908 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 800 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.9 
 
 		 945 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  33.26 
 
 		 1194 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.01 
 
 		 953 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 272 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.91 
 
 		 245 aa  293  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 232 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  56.19 
 
 		 392 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  47.66 
 
 		 247 aa  211  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  44.5 
 
 		 260 aa  207  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  48.84 
 
 		 276 aa  207  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  48.61 
 
 		 895 aa  205  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  47 
 
 		 255 aa  193  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  39.34 
 
 		 279 aa  192  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  43.78 
 
 		 275 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  45.41 
 
 		 285 aa  180  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 277 aa  172  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.22 
 
 		 1029 aa  155  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  34.47 
 
 		 375 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  25.79 
 
 		 1081 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.52 
 
 		 892 aa  127  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  35.37 
 
 		 292 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  30.95 
 
 		 346 aa  118  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  25.81 
 
 		 999 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  25.81 
 
 		 999 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  25.45 
 
 		 999 aa  114  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  29.8 
 
 		 411 aa  109  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  23.76 
 
 		 1657 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  24.91 
 
 		 712 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  26.03 
 
 		 841 aa  105  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  28 
 
 		 392 aa  102  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  27.72 
 
 		 374 aa  101  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  29.39 
 
 		 388 aa  101  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 		 382 aa  100  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  26.16 
 
 		 366 aa  99.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  28.67 
 
 		 407 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  28.95 
 
 		 383 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  30.45 
 
 		 376 aa  97.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  28.52 
 
 		 413 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  29.23 
 
 		 296 aa  96.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.61 
 
 		 412 aa  96.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  26.95 
 
 		 387 aa  95.5  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  27.86 
 
 		 388 aa  95.5  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.21 
 
 		 585 aa  94  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.41 
 
 		 387 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.98 
 
 		 442 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  27.82 
 
 		 382 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.97 
 
 		 369 aa  92.4  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  23.88 
 
 		 530 aa  92.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.97 
 
 		 394 aa  92.4  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  28.04 
 
 		 387 aa  92  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  26.97 
 
 		 395 aa  92.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  29.35 
 
 		 381 aa  92  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  26.97 
 
 		 395 aa  92  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  23.38 
 
 		 405 aa  91.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.76 
 
 		 396 aa  91.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  26.62 
 
 		 386 aa  90.9  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  26.35 
 
 		 430 aa  91.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 		 360 aa  91.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.15 
 
 		 450 aa  89  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  24.19 
 
 		 394 aa  89.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  27.61 
 
 		 342 aa  89.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 387 aa  88.6  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  26.28 
 
 		 378 aa  88.2  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  27.7 
 
 		 382 aa  88.2  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  23.48 
 
 		 1132 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  25.22 
 
 		 418 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  27.62 
 
 		 405 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  28.4 
 
 		 266 aa  87.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  28.25 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  28.87 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  26.98 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  49.43 
 
 		 118 aa  85.5  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.37 
 
 		 1180 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  27.7 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  27.64 
 
 		 383 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  31.86 
 
 		 258 aa  84.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.3 
 
 		 379 aa  84.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  26.87 
 
 		 306 aa  84.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  25.61 
 
 		 465 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  28.26 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  26.23 
 
 		 466 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  25.9 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>