More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4878 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1081 aa  2216    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.79 
 
 		 1029 aa  174  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.19 
 
 		 945 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  27.49 
 
 		 841 aa  160  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.26 
 
 		 1505 aa  155  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  30.85 
 
 		 999 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  30.65 
 
 		 999 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  30.65 
 
 		 999 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1182 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.35 
 
 		 953 aa  144  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.42 
 
 		 1200 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  25.67 
 
 		 918 aa  142  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.63 
 
 		 892 aa  138  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  26.4 
 
 		 1135 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  25.79 
 
 		 1143 aa  131  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  24.93 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  27.97 
 
 		 908 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  23.64 
 
 		 1138 aa  115  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  24.37 
 
 		 984 aa  114  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  24.23 
 
 		 918 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  26.28 
 
 		 941 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  24.53 
 
 		 1151 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  23 
 
 		 1657 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  23.52 
 
 		 909 aa  105  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  22.09 
 
 		 1142 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.65 
 
 		 3544 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.05 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  38.1 
 
 		 731 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.24 
 
 		 11716 aa  84.7  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  25.11 
 
 		 419 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  37.62 
 
 		 2001 aa  80.9  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.6 
 
 		 450 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.81 
 
 		 387 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6298  hypothetical protein  24.44 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.16 
 
 		 3699 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.01 
 
 		 3598 aa  78.2  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  27.63 
 
 		 422 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.14 
 
 		 442 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  33.17 
 
 		 2954 aa  77  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.9 
 
 		 3699 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  24.5 
 
 		 2402 aa  75.5  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.14 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29 
 
 		 2172 aa  75.1  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  35.71 
 
 		 2522 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  35.11 
 
 		 2820 aa  74.3  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.29 
 
 		 392 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  24.39 
 
 		 471 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  38.89 
 
 		 712 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 		 4231 aa  72.4  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.38 
 
 		 455 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.62 
 
 		 451 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.95 
 
 		 1444 aa  70.1  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  28.96 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  26.88 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  33.65 
 
 		 2853 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  42.55 
 
 		 884 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.24 
 
 		 809 aa  68.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  28.57 
 
 		 962 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.75 
 
 		 3911 aa  68.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  25.81 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  26.6 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  27.82 
 
 		 1771 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.52 
 
 		 427 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  30.48 
 
 		 965 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  38.78 
 
 		 2337 aa  66.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.09 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  36.21 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  32.82 
 
 		 965 aa  65.1  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  32.82 
 
 		 965 aa  65.1  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  30 
 
 		 965 aa  64.7  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  42.74 
 
 		 1728 aa  64.7  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  26.34 
 
 		 374 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  29.63 
 
 		 965 aa  64.3  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  32.04 
 
 		 2132 aa  64.3  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.9 
 
 		 1916 aa  64.3  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.72 
 
 		 1565 aa  64.3  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  26.34 
 
 		 374 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.73 
 
 		 816 aa  63.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  25.86 
 
 		 400 aa  63.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.51 
 
 		 3542 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  31.65 
 
 		 965 aa  62.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  44.83 
 
 		 3230 aa  62.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  25.08 
 
 		 1132 aa  62.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  28.34 
 
 		 965 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  27.98 
 
 		 399 aa  62  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  31.61 
 
 		 861 aa  61.6  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  39.64 
 
 		 873 aa  61.6  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  30 
 
 		 965 aa  61.6  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  41 
 
 		 3222 aa  61.6  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  32 
 
 		 2271 aa  61.6  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  37.89 
 
 		 4465 aa  61.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  33.89 
 
 		 2506 aa  61.2  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  32 
 
 		 2271 aa  61.6  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  23.41 
 
 		 972 aa  61.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  41.58 
 
 		 2036 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  41.58 
 
 		 1969 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  24.74 
 
 		 461 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  40.78 
 
 		 2066 aa  61.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  28.34 
 
 		 965 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>