90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4374 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  100 
 
 
731 aa  1456    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  47.29 
 
 
1426 aa  267  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.22 
 
 
912 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.04 
 
 
884 aa  207  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03791  glycosyl hydrolase, family 16  36.55 
 
 
437 aa  196  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000024164  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  52.79 
 
 
3544 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  47.83 
 
 
2522 aa  152  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.88 
 
 
3699 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  47.92 
 
 
3699 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  40 
 
 
1918 aa  118  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  41.98 
 
 
2476 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  41.67 
 
 
2503 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  39.78 
 
 
2636 aa  101  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  37.26 
 
 
3474 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  38.3 
 
 
1779 aa  96.3  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.81 
 
 
11716 aa  92.8  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  38 
 
 
2820 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  34.13 
 
 
2853 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  35.08 
 
 
2079 aa  91.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.42 
 
 
2839 aa  90.5  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  37.02 
 
 
2001 aa  89.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  38.96 
 
 
3598 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  34.6 
 
 
2233 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  37.25 
 
 
2132 aa  81.6  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  34.41 
 
 
3244 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  37.13 
 
 
4465 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  41.94 
 
 
1238 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  40.27 
 
 
1081 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  36.23 
 
 
683 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  27.5 
 
 
3563 aa  73.9  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  30.19 
 
 
4231 aa  73.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.83 
 
 
2402 aa  72  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  37.34 
 
 
1879 aa  70.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.05 
 
 
2954 aa  70.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  31.55 
 
 
1232 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  37.65 
 
 
5020 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.57 
 
 
2507 aa  65.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  32.47 
 
 
1002 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.56 
 
 
692 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  37.36 
 
 
1222 aa  61.6  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.76 
 
 
3089 aa  60.8  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.33 
 
 
1055 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.31 
 
 
1673 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  32.11 
 
 
1672 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  40.22 
 
 
1126 aa  59.3  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  28.64 
 
 
2334 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 
1092 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.02 
 
 
742 aa  58.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32797  predicted protein  32.14 
 
 
1479 aa  58.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.480119  normal  0.167383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  35.29 
 
 
3222 aa  57  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  31.07 
 
 
2715 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  32.17 
 
 
672 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  28.36 
 
 
962 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  32.22 
 
 
3911 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.89 
 
 
3542 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  28.09 
 
 
4022 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  35.46 
 
 
2271 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  35.46 
 
 
2271 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  38.05 
 
 
494 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1130  PKD domain containing protein  34.53 
 
 
514 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181278  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
2701 aa  52  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  32.28 
 
 
3230 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  32.74 
 
 
5769 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  25.25 
 
 
1544 aa  51.2  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.29 
 
 
887 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  28.87 
 
 
1421 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  34.13 
 
 
409 aa  48.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37 
 
 
1019 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  32.92 
 
 
694 aa  48.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  33.8 
 
 
857 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.87 
 
 
2074 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.25 
 
 
2296 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50000  polarity establishment/cellular polarization  36.25 
 
 
893 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.457642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2433  hypothetical protein  28.57 
 
 
533 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634913  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.31 
 
 
994 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  36.49 
 
 
2831 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  34.39 
 
 
1631 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  26.47 
 
 
535 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  40.43 
 
 
1342 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  29.7 
 
 
2961 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  32.69 
 
 
840 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  30.56 
 
 
1610 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  34.9 
 
 
1148 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  37.93 
 
 
1030 aa  44.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1125  hypothetical protein  36.62 
 
 
657 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.837381  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1126  hypothetical protein  36.62 
 
 
657 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  34.51 
 
 
884 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3525  Ig family protein  38.24 
 
 
638 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.464381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  32.19 
 
 
1626 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  30 
 
 
618 aa  44.3  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>