More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0582 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  100 
 
 		 1019 aa  1956    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  75.2 
 
 		 1055 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  58.72 
 
 		 1222 aa  356  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  58.72 
 
 		 1118 aa  353  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  58.43 
 
 		 1340 aa  350  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  55.72 
 
 		 2194 aa  349  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  57.27 
 
 		 1225 aa  340  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  57.59 
 
 		 1113 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  55.23 
 
 		 889 aa  320  6e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  54 
 
 		 1012 aa  313  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  39.42 
 
 		 813 aa  309  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  36.3 
 
 		 1838 aa  282  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.79 
 
 		 1009 aa  282  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.13 
 
 		 891 aa  259  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  39.29 
 
 		 828 aa  247  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  43.18 
 
 		 3209 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  42.95 
 
 		 412 aa  237  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  40.69 
 
 		 872 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.68 
 
 		 2807 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  37.01 
 
 		 644 aa  207  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  36.95 
 
 		 1557 aa  206  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  36.61 
 
 		 2954 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  36.68 
 
 		 386 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  50.98 
 
 		 917 aa  188  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  36.13 
 
 		 554 aa  181  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  39.04 
 
 		 1037 aa  174  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  29.46 
 
 		 4379 aa  173  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1289 aa  173  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  36.66 
 
 		 1490 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  37.07 
 
 		 1275 aa  172  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  36.89 
 
 		 1126 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  45.49 
 
 		 727 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  38.62 
 
 		 395 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.69 
 
 		 588 aa  162  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  38.1 
 
 		 395 aa  161  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  37.83 
 
 		 820 aa  157  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 1175 aa  154  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 3954 aa  153  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  52.27 
 
 		 1855 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 		 3427 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.85 
 
 		 2701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  36.42 
 
 		 604 aa  148  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.62 
 
 		 1180 aa  147  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  36.68 
 
 		 462 aa  145  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  43.85 
 
 		 475 aa  145  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  38.66 
 
 		 662 aa  144  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  41.92 
 
 		 824 aa  141  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  36.02 
 
 		 503 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  43.03 
 
 		 475 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.44 
 
 		 1415 aa  140  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  48.02 
 
 		 4334 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  35.82 
 
 		 709 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  33.41 
 
 		 974 aa  137  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  46.79 
 
 		 1197 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  43.09 
 
 		 9867 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  37.77 
 
 		 940 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  43.12 
 
 		 467 aa  135  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  34.72 
 
 		 1022 aa  134  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  36.05 
 
 		 4465 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  34.72 
 
 		 1017 aa  134  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 503 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.74 
 
 		 1372 aa  132  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  32.57 
 
 		 657 aa  132  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  40.4 
 
 		 8871 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  31.85 
 
 		 574 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.89 
 
 		 616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  43.2 
 
 		 922 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  35.58 
 
 		 652 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  45.2 
 
 		 1346 aa  129  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  39.8 
 
 		 946 aa  128  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  37.09 
 
 		 448 aa  128  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.44 
 
 		 547 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  36.96 
 
 		 546 aa  127  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  34.06 
 
 		 907 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  43.45 
 
 		 2461 aa  126  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  38.42 
 
 		 2133 aa  124  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  39.58 
 
 		 337 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  40.76 
 
 		 8980 aa  122  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  32.74 
 
 		 485 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  36.12 
 
 		 3026 aa  121  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  33.08 
 
 		 1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.08 
 
 		 1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  38.8 
 
 		 1079 aa  119  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.19 
 
 		 3363 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  35.11 
 
 		 595 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  38.74 
 
 		 1764 aa  119  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  40.14 
 
 		 3391 aa  119  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  35.94 
 
 		 2132 aa  118  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.5 
 
 		 2105 aa  118  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  37.06 
 
 		 2853 aa  118  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  49.14 
 
 		 3608 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.05 
 
 		 1236 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  46.71 
 
 		 486 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  41.25 
 
 		 2198 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  42.01 
 
 		 1883 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.98 
 
 		 2667 aa  115  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  48.57 
 
 		 3619 aa  115  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.1 
 
 		 3619 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  42.74 
 
 		 589 aa  114  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  44.72 
 
 		 1532 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>