More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3878 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3878  lipase  100 
 
 		 709 aa  1420    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  54.55 
 
 		 652 aa  204  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  51.43 
 
 		 1175 aa  174  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.45 
 
 		 3427 aa  174  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  46.26 
 
 		 1022 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  46.26 
 
 		 1017 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.23 
 
 		 1372 aa  157  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.37 
 
 		 588 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50.26 
 
 		 547 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  37.73 
 
 		 1055 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  44.83 
 
 		 1346 aa  148  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  47.42 
 
 		 917 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.82 
 
 		 1019 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  45.66 
 
 		 813 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  38.21 
 
 		 1037 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  33.45 
 
 		 395 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  32.2 
 
 		 395 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.07 
 
 		 1180 aa  97.4  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.11 
 
 		 2346 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 327 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  51.58 
 
 		 2105 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.3 
 
 		 1236 aa  91.3  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.62 
 
 		 1164 aa  90.9  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  45.3 
 
 		 2667 aa  90.9  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.69 
 
 		 2885 aa  90.9  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  47.46 
 
 		 3619 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  47.46 
 
 		 3619 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.91 
 
 		 1963 aa  88.2  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.61 
 
 		 1795 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44.6 
 
 		 202 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  44.6 
 
 		 202 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.92 
 
 		 4106 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  42.03 
 
 		 219 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  42.19 
 
 		 195 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.03 
 
 		 2775 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  36.65 
 
 		 615 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  35.75 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  35.62 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  34.5 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  46.9 
 
 		 1499 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.04 
 
 		 2067 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  48.96 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.03 
 
 		 1712 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  41.43 
 
 		 709 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.85 
 
 		 1895 aa  82  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.28 
 
 		 5839 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  44.88 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  51.09 
 
 		 946 aa  82.4  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  46.9 
 
 		 1156 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  41.73 
 
 		 757 aa  82  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  32.38 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 795 aa  82  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  34.43 
 
 		 938 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.88 
 
 		 2954 aa  81.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  45.74 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  48.96 
 
 		 1424 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 		 1553 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.91 
 
 		 980 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  39.47 
 
 		 2329 aa  80.9  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.64 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 1016 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  41.59 
 
 		 467 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  48.89 
 
 		 2704 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42.25 
 
 		 1287 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  39.66 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.76 
 
 		 4798 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  48.91 
 
 		 4678 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  36.78 
 
 		 942 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1538 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  43.2 
 
 		 561 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  43.1 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  52.94 
 
 		 950 aa  78.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.25 
 
 		 5962 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  31.9 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  48.91 
 
 		 855 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.26 
 
 		 2678 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  43.1 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  49.48 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.08 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.79 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  38.73 
 
 		 5171 aa  77.8  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  31.74 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  46.88 
 
 		 1594 aa  77.4  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  50 
 
 		 1814 aa  76.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  48.81 
 
 		 5218 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  41.54 
 
 		 606 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.97 
 
 		 485 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.88 
 
 		 4334 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  49.43 
 
 		 3954 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  40.87 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  45.16 
 
 		 867 aa  76.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  51.69 
 
 		 679 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  45.36 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.39 
 
 		 686 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  43.66 
 
 		 1197 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  40.88 
 
 		 982 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  41.96 
 
 		 1383 aa  75.1  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  52.27 
 
 		 850 aa  75.1  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.24 
 
 		 4836 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>