More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1114 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  100 
 
 
280 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  99.29 
 
 
280 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  51.08 
 
 
1164 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  51.83 
 
 
946 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.15 
 
 
980 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  44.9 
 
 
491 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.36 
 
 
588 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  50.96 
 
 
595 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  49.1 
 
 
1424 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40.94 
 
 
589 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.72 
 
 
1795 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.32 
 
 
3427 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.56 
 
 
2105 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  47.03 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  50.72 
 
 
2954 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  44.35 
 
 
1363 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44.6 
 
 
460 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.35 
 
 
2667 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  49.02 
 
 
1279 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  43.13 
 
 
615 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  47.37 
 
 
4334 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  35.95 
 
 
437 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  44.52 
 
 
1895 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
1534 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  50.25 
 
 
526 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  46.88 
 
 
1400 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 
219 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  48.77 
 
 
982 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  45.08 
 
 
387 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  38.1 
 
 
273 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  46.61 
 
 
833 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  48.44 
 
 
1287 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  49.01 
 
 
1532 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  35.14 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.61 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.45 
 
 
421 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.04 
 
 
1236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  40.47 
 
 
3619 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  40.47 
 
 
3619 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  42.86 
 
 
813 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  41.96 
 
 
709 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.04 
 
 
3954 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.89 
 
 
341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  47.69 
 
 
1043 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.9 
 
 
2668 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  44.59 
 
 
1855 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  47.35 
 
 
965 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  46.56 
 
 
795 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  42.75 
 
 
460 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  41.02 
 
 
387 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  40.78 
 
 
613 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 
9867 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
243 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.58 
 
 
1712 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  44.07 
 
 
850 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  41.7 
 
 
2145 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.76 
 
 
1016 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  48.45 
 
 
734 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.47 
 
 
1963 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  43.82 
 
 
757 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  45.05 
 
 
741 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  40.25 
 
 
686 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.54 
 
 
2775 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  48.13 
 
 
5171 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  43.98 
 
 
355 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.57 
 
 
950 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  41.05 
 
 
363 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  43.04 
 
 
1883 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  44.8 
 
 
424 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  48.55 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  46.52 
 
 
824 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.25 
 
 
2678 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  40.3 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  39.24 
 
 
820 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  40.08 
 
 
396 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  49.23 
 
 
1197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  37.05 
 
 
2885 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.79 
 
 
1079 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  54.41 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  47.5 
 
 
729 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  54.41 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  46.95 
 
 
1383 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
245 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  43.07 
 
 
606 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  46.89 
 
 
679 aa  112  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  38.64 
 
 
3608 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  46.59 
 
 
572 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  43.96 
 
 
724 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 
4687 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.13 
 
 
2689 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.6 
 
 
485 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  43.37 
 
 
742 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  46.29 
 
 
959 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  39.2 
 
 
257 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  39.27 
 
 
833 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  46.77 
 
 
518 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  44.27 
 
 
728 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  39.06 
 
 
860 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>