More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0513 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  944    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  98.95 
 
 		 475 aa  935    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  70.59 
 
 		 467 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  53.01 
 
 		 3954 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  50.28 
 
 		 3209 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  41.28 
 
 		 1197 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.8 
 
 		 4334 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  42.86 
 
 		 1029 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.86 
 
 		 1029 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  47.12 
 
 		 727 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  37.17 
 
 		 3608 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.88 
 
 		 2954 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 		 907 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  50.79 
 
 		 820 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  43.03 
 
 		 1019 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.76 
 
 		 3619 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.46 
 
 		 3619 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  40.34 
 
 		 260 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  43.39 
 
 		 1055 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.53 
 
 		 1415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  37.6 
 
 		 2133 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  38.96 
 
 		 2198 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.08 
 
 		 2667 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  38.46 
 
 		 2807 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  44.75 
 
 		 824 aa  127  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  39.05 
 
 		 1079 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  50.64 
 
 		 202 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  50.64 
 
 		 202 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  38.98 
 
 		 2467 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  40.61 
 
 		 1855 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.54 
 
 		 1712 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  40.09 
 
 		 768 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.38 
 
 		 2775 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.7 
 
 		 1795 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.02 
 
 		 2105 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  45.34 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.74 
 
 		 855 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.49 
 
 		 1236 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  48.1 
 
 		 3026 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  39.55 
 
 		 757 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  44.72 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  46.47 
 
 		 574 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  34.39 
 
 		 460 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  39.84 
 
 		 1164 aa  113  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.15 
 
 		 588 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  35.57 
 
 		 851 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.45 
 
 		 980 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  44.38 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  35.12 
 
 		 1764 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 2885 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  36.42 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.82 
 
 		 2668 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  38.36 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  50.39 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.59 
 
 		 3427 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  34.72 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  37.26 
 
 		 1134 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  48.57 
 
 		 614 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  36.86 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  38.18 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  35.89 
 
 		 709 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  33.57 
 
 		 363 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.77 
 
 		 1499 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  32.81 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  36.63 
 
 		 1133 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  37.8 
 
 		 1895 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  39.72 
 
 		 946 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32.66 
 
 		 813 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 219 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 		 341 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  40.47 
 
 		 1582 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 1610 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  38.64 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.12 
 
 		 2701 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  38.91 
 
 		 5171 aa  97.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  34.86 
 
 		 1557 aa  97.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.18 
 
 		 485 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  34.69 
 
 		 1480 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.49 
 
 		 1156 aa  97.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  42.76 
 
 		 448 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  41.5 
 
 		 437 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  33.21 
 
 		 686 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  38.39 
 
 		 219 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  48.32 
 
 		 1650 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  38.82 
 
 		 437 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  42.59 
 
 		 303 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  39.62 
 
 		 2950 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  53.7 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 341 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  52.78 
 
 		 531 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  37.57 
 
 		 2097 aa  93.2  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  36.4 
 
 		 1383 aa  93.2  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.35 
 
 		 1424 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  39.11 
 
 		 867 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.1 
 
 		 833 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  34.12 
 
 		 245 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  30.42 
 
 		 9867 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  34.73 
 
 		 795 aa  91.3  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 759 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  36.65 
 
 		 1534 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>