224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1397 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  66.35 
 
 		 531 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  100 
 
 		 614 aa  1223    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  66.73 
 
 		 531 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  50.93 
 
 		 820 aa  392  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  43.22 
 
 		 451 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  45.48 
 
 		 1631 aa  244  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  42.01 
 
 		 785 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50.45 
 
 		 1029 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  50.45 
 
 		 1029 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  38.33 
 
 		 476 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  37.79 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  35.33 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  32.65 
 
 		 727 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  35.67 
 
 		 476 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  36.22 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  36.61 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  38.14 
 
 		 474 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  37.11 
 
 		 504 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  36.08 
 
 		 478 aa  150  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  35.45 
 
 		 481 aa  150  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  36.18 
 
 		 490 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  31.82 
 
 		 479 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  35.22 
 
 		 480 aa  145  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  39.31 
 
 		 1133 aa  144  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  37.34 
 
 		 1134 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  33.91 
 
 		 479 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 		 540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  40.34 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  38.79 
 
 		 540 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  34.93 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.74 
 
 		 1415 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  30.33 
 
 		 1112 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  33.09 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  33.09 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  32.63 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  29.61 
 
 		 1112 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  31.88 
 
 		 444 aa  113  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  49.29 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  35.77 
 
 		 1072 aa  107  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  29.7 
 
 		 648 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  48.57 
 
 		 475 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 467 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  50.93 
 
 		 1764 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  34.84 
 
 		 395 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  46.05 
 
 		 768 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  36.07 
 
 		 395 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  44.2 
 
 		 3209 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  55.88 
 
 		 2954 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  30.88 
 
 		 513 aa  94.7  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 4334 aa  93.6  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  53.06 
 
 		 851 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  48.21 
 
 		 462 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  31.96 
 
 		 486 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  30.23 
 
 		 745 aa  92.8  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  36.15 
 
 		 357 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31 
 
 		 1019 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  35.68 
 
 		 3954 aa  89  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  36 
 
 		 448 aa  88.6  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 1855 aa  88.6  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  35.56 
 
 		 503 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 503 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  49.07 
 
 		 1532 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  31.49 
 
 		 1055 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  48.15 
 
 		 1534 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  48.65 
 
 		 2807 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  33.78 
 
 		 606 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 		 2467 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.79 
 
 		 3619 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  41.79 
 
 		 3619 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  44.96 
 
 		 3608 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  34.09 
 
 		 621 aa  84  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.12 
 
 		 1610 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  35.71 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  47.5 
 
 		 907 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  41.24 
 
 		 2133 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  32.07 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.44 
 
 		 2701 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2307  hemolysin-type calcium-binding region  35.25 
 
 		 145 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.138932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 713 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  49.04 
 
 		 2198 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 713 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 		 2097 aa  78.2  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  38.56 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  49.02 
 
 		 1610 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  29.61 
 
 		 861 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  39.35 
 
 		 2950 aa  76.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  39.86 
 
 		 475 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.16 
 
 		 1197 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  45.71 
 
 		 3026 aa  74.7  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.47 
 
 		 2346 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  34.33 
 
 		 1628 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.17 
 
 		 928 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  33.77 
 
 		 656 aa  71.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  37.01 
 
 		 1557 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  38.56 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  32.82 
 
 		 641 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.36 
 
 		 2667 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  31.88 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>