More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3363 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  70.09 
 
 		 475 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  100 
 
 		 468 aa  938    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  69.72 
 
 		 476 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  67.82 
 
 		 486 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  62 
 
 		 479 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  61.78 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  52.77 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  53.8 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  54.01 
 
 		 504 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  53.5 
 
 		 476 aa  445  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  53.29 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  51.02 
 
 		 490 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  50.74 
 
 		 480 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  40.53 
 
 		 444 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  40.53 
 
 		 442 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  41.75 
 
 		 444 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  38.39 
 
 		 727 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  38.61 
 
 		 1631 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  37.03 
 
 		 614 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  36.66 
 
 		 785 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  33.5 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  37.25 
 
 		 531 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  36.93 
 
 		 531 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.24 
 
 		 820 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  31.52 
 
 		 1133 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.86 
 
 		 648 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  33.43 
 
 		 1134 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  30.98 
 
 		 745 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  30.61 
 
 		 513 aa  126  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  33.71 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  34.49 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  32.67 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.61 
 
 		 928 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  36.89 
 
 		 713 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  36.29 
 
 		 713 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 1112 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  29.45 
 
 		 1112 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  38.58 
 
 		 641 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  32.08 
 
 		 861 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  32.79 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  38.46 
 
 		 1037 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.37 
 
 		 768 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  33.96 
 
 		 656 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  51.72 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  52.17 
 
 		 2467 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 759 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  27.67 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  45.05 
 
 		 2743 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  41.18 
 
 		 856 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.41 
 
 		 1180 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  49.43 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  43.4 
 
 		 2133 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  35.18 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 686 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  40.74 
 
 		 2524 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  37.06 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  46.51 
 
 		 768 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  43.8 
 
 		 1403 aa  64.7  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  38.05 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.39 
 
 		 2678 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  49.35 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  46.99 
 
 		 2198 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  53.85 
 
 		 907 aa  64.3  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  44.55 
 
 		 1610 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 		 1286 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  45 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  45.16 
 
 		 1883 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.39 
 
 		 556 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  51.35 
 
 		 2701 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.74 
 
 		 1839 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  43.37 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  48.1 
 
 		 5171 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  53.33 
 
 		 2768 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.35 
 
 		 1052 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.87 
 
 		 1269 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  47.44 
 
 		 1019 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.38 
 
 		 826 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  46.67 
 
 		 998 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  49.38 
 
 		 998 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.87 
 
 		 1269 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.94 
 
 		 1029 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  43.62 
 
 		 1610 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  41.67 
 
 		 1168 aa  60.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  44.83 
 
 		 1145 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  41.94 
 
 		 1029 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  44.58 
 
 		 889 aa  60.1  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  46.15 
 
 		 686 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  44.44 
 
 		 858 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  34.67 
 
 		 621 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.33 
 
 		 621 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  44.58 
 
 		 4678 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  45.12 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.33 
 
 		 2812 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.35 
 
 		 874 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  48 
 
 		 4285 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.42 
 
 		 5839 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  50.79 
 
 		 817 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  52.05 
 
 		 4214 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>