More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4246 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
539 aa  1055    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  30.36 
 
 
760 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  33.25 
 
 
861 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  33.55 
 
 
470 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  29.87 
 
 
690 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  29.77 
 
 
688 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  31.94 
 
 
940 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  31.56 
 
 
912 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.8 
 
 
1154 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  31.73 
 
 
828 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  31.33 
 
 
3041 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  34.74 
 
 
3193 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.49 
 
 
1372 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  28.24 
 
 
1308 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  51.75 
 
 
713 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  50.88 
 
 
713 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  34.08 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  36.93 
 
 
606 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  31.68 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.5 
 
 
2346 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  35.87 
 
 
727 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  43.86 
 
 
3209 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  43.36 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  53.01 
 
 
467 aa  73.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  51.85 
 
 
589 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.22 
 
 
3619 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  46.22 
 
 
3619 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  37.57 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  41.35 
 
 
3608 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  43.38 
 
 
1145 aa  71.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  43.15 
 
 
9030 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  42.48 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  52.13 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  50.51 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  44.76 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  30.64 
 
 
506 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  39.71 
 
 
2836 aa  70.5  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  51.58 
 
 
313 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  52.38 
 
 
1814 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.14 
 
 
5839 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  42.47 
 
 
8682 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  52.56 
 
 
2704 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  42.36 
 
 
6753 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  45.69 
 
 
1019 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  31.56 
 
 
679 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  46.3 
 
 
1532 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 
475 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  45.3 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.85 
 
 
588 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  50 
 
 
1055 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  49.46 
 
 
680 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  51.81 
 
 
2667 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  43.65 
 
 
2775 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  50.57 
 
 
2542 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  44.44 
 
 
2689 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  38.85 
 
 
2251 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  43.81 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  44.64 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  54.32 
 
 
1526 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  42.14 
 
 
2452 aa  67.4  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  51.85 
 
 
1017 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  51.85 
 
 
1022 aa  66.6  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  47.42 
 
 
585 aa  66.6  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  50.59 
 
 
1156 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  52.33 
 
 
5218 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  42.86 
 
 
486 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.38 
 
 
1236 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  48.75 
 
 
950 aa  66.6  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  48.96 
 
 
1166 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  44.05 
 
 
195 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.86 
 
 
1279 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.11 
 
 
2678 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  45.97 
 
 
1534 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  40.29 
 
 
1699 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.98 
 
 
3427 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  55.41 
 
 
437 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  41.38 
 
 
2885 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  48.28 
 
 
4687 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  53.95 
 
 
813 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  48.24 
 
 
1499 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  43.69 
 
 
490 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  47.5 
 
 
572 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  54.88 
 
 
280 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  40.52 
 
 
7284 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  48.84 
 
 
4678 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  33.33 
 
 
614 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  46.34 
 
 
1346 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  52.5 
 
 
4334 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.92 
 
 
260 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  47.12 
 
 
833 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  51.06 
 
 
1582 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  42.72 
 
 
474 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.51 
 
 
2668 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  40.16 
 
 
1383 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.42 
 
 
3314 aa  64.7  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  54.05 
 
 
437 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 
5962 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.07 
 
 
2954 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  48.54 
 
 
686 aa  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  35 
 
 
769 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>