67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1950 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 861 aa  1703    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  44.23 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  42.14 
 
 		 688 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  40.73 
 
 		 760 aa  239  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  37.73 
 
 		 641 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  33.17 
 
 		 539 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  33.63 
 
 		 470 aa  148  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  38.98 
 
 		 828 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.65 
 
 		 1372 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.46 
 
 		 1154 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  34.77 
 
 		 1308 aa  122  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  28.48 
 
 		 690 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  30.49 
 
 		 3041 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  29.1 
 
 		 475 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  30.25 
 
 		 417 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  29.49 
 
 		 785 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  27.97 
 
 		 476 aa  101  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  35.27 
 
 		 409 aa  101  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.02 
 
 		 3193 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  32.08 
 
 		 468 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.74 
 
 		 940 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  29.61 
 
 		 614 aa  99  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  29.86 
 
 		 531 aa  97.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  27.89 
 
 		 476 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  30.08 
 
 		 531 aa  95.1  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  26.69 
 
 		 474 aa  94  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  28.28 
 
 		 490 aa  94  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  26.63 
 
 		 486 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  28.86 
 
 		 478 aa  91.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  29.63 
 
 		 479 aa  92  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  28.51 
 
 		 481 aa  91.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  28.86 
 
 		 479 aa  92  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  26.41 
 
 		 480 aa  89.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  29.78 
 
 		 506 aa  90.1  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  27.48 
 
 		 727 aa  87.8  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 820 aa  87.8  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  28.99 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  28.12 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  26.91 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  28.35 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  33.33 
 
 		 1631 aa  80.9  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  27.7 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  29.03 
 
 		 912 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  26.54 
 
 		 1112 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  25.35 
 
 		 1134 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  25.82 
 
 		 1112 aa  67.4  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  27.76 
 
 		 1133 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  27.2 
 
 		 745 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  25 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  26.36 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  24.31 
 
 		 1348 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  29.17 
 
 		 534 aa  54.7  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0330  FG-GAP repeat protein  24.82 
 
 		 732 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.87032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  25.6 
 
 		 486 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  26.4 
 
 		 535 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  24.68 
 
 		 535 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  25.86 
 
 		 1094 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.52 
 
 		 1269 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.6 
 
 		 1201 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.52 
 
 		 1269 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  30 
 
 		 883 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  23.83 
 
 		 1337 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.5 
 
 		 1126 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  22.77 
 
 		 2497 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  21.05 
 
 		 1434 aa  45.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.17 
 
 		 928 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  25.35 
 
 		 1433 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>