More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3402 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  100 
 
 		 451 aa  905    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  45.81 
 
 		 531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  45.53 
 
 		 531 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  43.19 
 
 		 820 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  43.22 
 
 		 614 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  41.69 
 
 		 1631 aa  210  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  36.72 
 
 		 785 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  34.1 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  34.55 
 
 		 474 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  37.43 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  38.46 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  35.09 
 
 		 504 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  33.11 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  33.58 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  31.54 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  32.51 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  31.7 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  33.42 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  32.25 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  33.92 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  31.4 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  31.4 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  34.88 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  31.94 
 
 		 727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  34.84 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  37.55 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.11 
 
 		 648 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  37.05 
 
 		 606 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  29.28 
 
 		 1112 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  32.11 
 
 		 745 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 1112 aa  86.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  31.08 
 
 		 1134 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.41 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  32.81 
 
 		 713 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.16 
 
 		 1079 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  40.41 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  32.81 
 
 		 713 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  38.13 
 
 		 1844 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  37.75 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  28.16 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  41.79 
 
 		 1037 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  30.83 
 
 		 1133 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.39 
 
 		 1180 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.69 
 
 		 1027 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.22 
 
 		 2346 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  36.94 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.07 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  38.93 
 
 		 998 aa  65.1  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  38.89 
 
 		 768 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.75 
 
 		 928 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  46.58 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  38.66 
 
 		 2145 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  31.82 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  28.35 
 
 		 861 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  36.54 
 
 		 537 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  33.09 
 
 		 678 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  35.51 
 
 		 998 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  39.52 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.25 
 
 		 2239 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 		 2668 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  34.78 
 
 		 1839 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1111 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1121 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.25 
 
 		 6683 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37.76 
 
 		 1883 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  39.13 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  39.84 
 
 		 4285 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  33.93 
 
 		 982 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  46.25 
 
 		 6779 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  46.25 
 
 		 6662 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.92 
 
 		 2667 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  33.33 
 
 		 641 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 		 1236 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  43.02 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  39.52 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1699 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  42.55 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  40.2 
 
 		 3209 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  38.82 
 
 		 2885 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  34.95 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.84 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  32.78 
 
 		 1287 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  31.08 
 
 		 938 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  36.19 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  29.26 
 
 		 1712 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.59 
 
 		 826 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  40.23 
 
 		 1202 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  42.71 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  33.96 
 
 		 1346 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.03 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.81 
 
 		 4106 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  38.68 
 
 		 2701 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  38 
 
 		 1164 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  27.39 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  39.62 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.13 
 
 		 577 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  41.98 
 
 		 917 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>