132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0118 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  99.32 
 
 		 442 aa  914    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  98.2 
 
 		 444 aa  907    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  100 
 
 		 444 aa  925    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  46.6 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  45.64 
 
 		 481 aa  316  6e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  46.64 
 
 		 474 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  43.02 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  45.48 
 
 		 476 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  42.66 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  42.35 
 
 		 490 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  44.13 
 
 		 479 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  46.74 
 
 		 479 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  49.85 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  42.24 
 
 		 475 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  42.61 
 
 		 476 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  40.09 
 
 		 468 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  33.96 
 
 		 727 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  35.37 
 
 		 785 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  38.43 
 
 		 1631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  30.07 
 
 		 513 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  41.15 
 
 		 531 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  34.29 
 
 		 535 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  40.62 
 
 		 531 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  30.95 
 
 		 648 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  33.09 
 
 		 614 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  32.92 
 
 		 1134 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  33.95 
 
 		 1133 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  31.4 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  31.85 
 
 		 745 aa  114  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  32.38 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  32.3 
 
 		 1112 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.67 
 
 		 820 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  31.25 
 
 		 1112 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  31.83 
 
 		 641 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  33.68 
 
 		 606 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  32.16 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  28.71 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  31.72 
 
 		 713 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.35 
 
 		 1883 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.52 
 
 		 928 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  32.26 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.75 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.85 
 
 		 1037 aa  66.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  28.18 
 
 		 861 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  41.11 
 
 		 998 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  31.72 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  26.77 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  44.78 
 
 		 2743 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  33.09 
 
 		 768 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0824  putative phage minor structural protein  33.08 
 
 		 3104 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0825  virulence determinant  33.08 
 
 		 3110 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.04 
 
 		 1839 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0145  putative phage minor structural protein  33.08 
 
 		 3104 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.520123  decreased coverage  0.0000000741368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.06 
 
 		 998 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  43.94 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33 
 
 		 1269 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  40.26 
 
 		 2524 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33 
 
 		 1269 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  30.97 
 
 		 1610 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.88 
 
 		 1180 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  28.4 
 
 		 681 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  31.53 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 2701 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  35.79 
 
 		 1557 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  40.85 
 
 		 856 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.57 
 
 		 874 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  36.19 
 
 		 539 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  30.22 
 
 		 621 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  40.85 
 
 		 858 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.22 
 
 		 2467 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  30.22 
 
 		 621 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.5 
 
 		 1403 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  44.29 
 
 		 851 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  25.55 
 
 		 1202 aa  50.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  27.05 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  36.67 
 
 		 889 aa  50.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  28.65 
 
 		 3094 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 		 2345 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  45.71 
 
 		 2768 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.65 
 
 		 1019 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.43 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.84 
 
 		 1502 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  40.54 
 
 		 1168 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  30.95 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  35.59 
 
 		 3587 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  36.78 
 
 		 4285 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  40.26 
 
 		 1764 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  35.59 
 
 		 3587 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  36.26 
 
 		 1529 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  40 
 
 		 901 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  32.69 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  44.29 
 
 		 5442 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  27.43 
 
 		 677 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  39.02 
 
 		 659 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.57 
 
 		 1712 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  41.43 
 
 		 681 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  39.13 
 
 		 3209 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  30.43 
 
 		 2133 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.84 
 
 		 1610 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  27.21 
 
 		 2097 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>