More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2111 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  76.61 
 
 
480 aa  729    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  73.24 
 
 
478 aa  717    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  100 
 
 
481 aa  971    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  64.09 
 
 
476 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  64.09 
 
 
474 aa  618  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  61.76 
 
 
504 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  54.18 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  53.47 
 
 
490 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  55.48 
 
 
486 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  51.67 
 
 
476 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  54.09 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  50.83 
 
 
475 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  53.96 
 
 
468 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  45.64 
 
 
442 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  45.64 
 
 
444 aa  316  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  45.06 
 
 
444 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  39.09 
 
 
727 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  40.54 
 
 
785 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  41.04 
 
 
1631 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  38.46 
 
 
451 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  40.59 
 
 
820 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  39.86 
 
 
1134 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  37.58 
 
 
531 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  37.58 
 
 
531 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  35.45 
 
 
614 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  34.6 
 
 
1133 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  31.83 
 
 
648 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  32.49 
 
 
513 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  35.65 
 
 
745 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  36.45 
 
 
535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  32.97 
 
 
535 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  38.66 
 
 
713 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  38.24 
 
 
713 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  37.14 
 
 
606 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  33.78 
 
 
641 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  29.65 
 
 
1112 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.52 
 
 
928 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  30.72 
 
 
1112 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  33.05 
 
 
486 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  41.98 
 
 
1037 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.68 
 
 
768 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.9 
 
 
1269 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.9 
 
 
1269 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.62 
 
 
1180 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  51.81 
 
 
2524 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  38.52 
 
 
2701 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  37.76 
 
 
2467 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  37.59 
 
 
2743 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  34.84 
 
 
2133 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  35.95 
 
 
515 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  28.51 
 
 
861 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  34.84 
 
 
2198 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  35.98 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.28 
 
 
686 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 
759 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  32.94 
 
 
656 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  40.15 
 
 
553 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 
2678 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  48.19 
 
 
1883 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  42.31 
 
 
4285 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  47.73 
 
 
768 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  42.48 
 
 
539 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.15 
 
 
2812 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  48.86 
 
 
2704 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  41.9 
 
 
917 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  44.44 
 
 
856 aa  67  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.53 
 
 
2668 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.11 
 
 
1403 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  45.88 
 
 
5218 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.26 
 
 
1839 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  33.73 
 
 
851 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  43.68 
 
 
901 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  29.67 
 
 
2887 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40 
 
 
556 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 
2097 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  39.83 
 
 
561 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  48.81 
 
 
6753 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  42.34 
 
 
1394 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  31.16 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  49.37 
 
 
532 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
1016 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  45.68 
 
 
686 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  33.93 
 
 
1764 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  43.52 
 
 
417 aa  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  27.92 
 
 
373 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.05 
 
 
1019 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  30.36 
 
 
362 aa  63.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  43.44 
 
 
709 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  48.05 
 
 
1610 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  47.13 
 
 
1480 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.16 
 
 
4106 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  48.68 
 
 
855 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  44.58 
 
 
889 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  43.27 
 
 
659 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  39.69 
 
 
677 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.05 
 
 
2239 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  44.23 
 
 
998 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  41.9 
 
 
486 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  40.57 
 
 
686 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>