More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5971 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3199  VCBS  46.17 
 
 		 4854 aa  753    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  100 
 
 		 1883 aa  3636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  40.59 
 
 		 2567 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.04 
 
 		 2812 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  36.01 
 
 		 1206 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  34.84 
 
 		 4285 aa  426  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  33.93 
 
 		 3229 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.13 
 
 		 2067 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  33.81 
 
 		 2743 aa  377  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  33.95 
 
 		 4661 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  34.08 
 
 		 5020 aa  362  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  30.48 
 
 		 3259 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  33.81 
 
 		 5094 aa  319  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.2 
 
 		 16311 aa  301  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.95 
 
 		 1553 aa  285  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  27.83 
 
 		 2784 aa  270  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  28.84 
 
 		 3439 aa  254  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  31.86 
 
 		 3758 aa  249  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.68 
 
 		 14916 aa  246  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  33.5 
 
 		 2127 aa  236  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.77 
 
 		 2239 aa  234  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  30.09 
 
 		 6678 aa  226  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  28.95 
 
 		 3182 aa  203  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.08 
 
 		 8871 aa  193  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.47 
 
 		 3508 aa  186  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.89 
 
 		 3714 aa  182  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.51 
 
 		 1599 aa  174  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  45.8 
 
 		 2911 aa  155  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.49 
 
 		 1079 aa  152  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  43.05 
 
 		 2775 aa  144  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  38.46 
 
 		 745 aa  143  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  41.58 
 
 		 1712 aa  143  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.07 
 
 		 1236 aa  142  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  31.65 
 
 		 3026 aa  139  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.07 
 
 		 3209 aa  135  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.87 
 
 		 2667 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.74 
 
 		 2678 aa  134  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  26.39 
 
 		 1141 aa  132  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  36.27 
 
 		 648 aa  129  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.42 
 
 		 1534 aa  125  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 		 946 aa  125  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.84 
 
 		 980 aa  125  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.69 
 
 		 9867 aa  125  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40.25 
 
 		 1424 aa  123  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.97 
 
 		 556 aa  123  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.74 
 
 		 1164 aa  121  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  43.4 
 
 		 1072 aa  120  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  42.52 
 
 		 2097 aa  119  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.84 
 
 		 387 aa  119  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  41.74 
 
 		 1287 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  40.17 
 
 		 709 aa  117  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.86 
 
 		 3427 aa  116  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  42.01 
 
 		 1019 aa  115  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.91 
 
 		 1795 aa  115  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.47 
 
 		 2954 aa  113  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.5 
 
 		 1544 aa  113  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  38.41 
 
 		 491 aa  113  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  42.98 
 
 		 460 aa  113  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  43.78 
 
 		 595 aa  112  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  36.1 
 
 		 2701 aa  112  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.33 
 
 		 2668 aa  112  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  37.41 
 
 		 2836 aa  111  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  37.99 
 
 		 615 aa  111  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42 
 
 		 1279 aa  112  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.78 
 
 		 2555 aa  111  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37.28 
 
 		 813 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.43 
 
 		 982 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  39.32 
 
 		 2105 aa  110  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  35.27 
 
 		 5171 aa  110  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.55 
 
 		 1532 aa  110  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.56 
 
 		 588 aa  109  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  39.11 
 
 		 589 aa  109  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  42.21 
 
 		 526 aa  109  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  37.89 
 
 		 759 aa  109  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 		 2885 aa  108  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.17 
 
 		 341 aa  108  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.5 
 
 		 2145 aa  108  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.78 
 
 		 833 aa  108  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  43.45 
 
 		 2704 aa  108  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  32.62 
 
 		 1112 aa  108  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  40.44 
 
 		 1582 aa  108  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  40.99 
 
 		 850 aa  107  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.79 
 
 		 3954 aa  106  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  39.2 
 
 		 795 aa  106  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  39.73 
 
 		 361 aa  106  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  39.73 
 
 		 361 aa  106  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.08 
 
 		 5962 aa  106  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.27 
 
 		 341 aa  106  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  36.95 
 
 		 329 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  37 
 
 		 260 aa  105  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  36.95 
 
 		 329 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  35.69 
 
 		 363 aa  105  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  37.32 
 
 		 1112 aa  105  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  40.81 
 
 		 1055 aa  104  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  26.81 
 
 		 2461 aa  104  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  37.76 
 
 		 3587 aa  105  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  37.92 
 
 		 3587 aa  104  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  39.04 
 
 		 361 aa  104  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.12 
 
 		 820 aa  103  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.78 
 
 		 1963 aa  103  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>